Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
BİYOİNFORMATİK İkinci Düzey TBT 511 1 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu dersin amacı, öğrencilerin biyoenformatik alanına hızla ulaşmalarına yardımcı olmak ve kendi araştırma alanlarındaki problemleri çözmek için biyoenformatik araçları kullanabilmelerini sağlamaktır.
Dersin Tanımı Biyoinformatik dersi biyoinformatikte kullanılan en önemli ve temel kavramları, yöntemleri ve araçları tanıtmak üzere tasarlanmıştır. Bu ders biyolojik bilimlerde yeni ve hızla gelişen biyoinformatik alanına titiz, disiplinler arası bir yaklaşım sağlamaktadır. Ayrıca biyolojik veriler, genom evrimi ve varyasyonları ve biyolojik veri tabanlarının düzenlenmesi, analizi, karşılaştırılması ve anatasyonunda faydalı bilgiler sunacaktır.

Dersin İçeriği
1 Biyoinformatikte kullanılan en önemli ve temel kavramlar, yöntemler ve araçlara giiriş
2 Nükleotid dizi veritabanlarına giriş
3 Protein dizi veritabanları
4 Sanger ve yeni nesil sekanslama teknolojileri
5 Pairwise sekans alignment ve veritabanı araması
6 Patern, Profil ve Multiple sekans alignment ve algoritmalar
7 Örnek çalışma
8 Ara Sınav
9 Veri tabanına sekans veri girişi
10 Genom varyasyon ve evrim araştırmaları
11 Biyolojik dizilerin anatasyonu
12 Filogenetik ve filogenomik analizler
13 Gen ifadesi ve DNA mikroarrayler
14 Örnek çalışma
15 Final Sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Öğrenciler genom biyoinformatik araçlarını kullanabilecektir.
2 Öğrenciler genom biyoinformatikde kullanılan en önemli ve temel kavram, yöntem ve araçları anlayacaklardır.
3 Bu ders biyolojik bilimlerde yeni ve hızla gelişen genom biyoinformatik alanında titiz, disiplinler arası bir bilgi sunmaktadır.
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Alanında edindiği ileri düzey bilgi ve becerileri akademik, mesleki ve kültürlerarası ortamlarda etkili biçimde kullanabilir.
2 Çin dili, edebiyatı, tarihi ve kültürüne ilişkin bilgileri farklı disiplinlerden yararlanarak bütüncül biçimde değerlendirir; yorumlarını kuramsal ve metinsel kanıtlarla destekleyebilir.
3 Çin dili ve edebiyatı alanında ulusal ve uluslararası akademik çevrelerde bilimsel tartışmalara katılabilir, alanıyla ilgili çalışmalar yürütebilir.
4 Çin dilinin sesbilim, biçimbilim, sözdizimi, anlambilim ve biçembilim gibi alt alanlarında ileri düzey bilgi sahibi olur ve bu bilgileri çözümleme süreçlerinde kullanabilir.
5 Çin yazısının kökeni, tarihsel gelişimi, yapısal özellikleri ve anlam üretim süreçleri hakkında ileri düzey bilgi edinir; yazılı metinleri bu çerçevede değerlendirebilir.
6 Farklı dönem, tür ve ekollere ait klasik ve modern Çin edebiyatı metinlerini, Çin edebiyatı, düşüncesi ve kültür tarihinin gelişim süreçleri ve temel kırılma noktaları doğrultusunda tarihsel, toplumsal, kültürel ve düşünsel bağlamları içinde eleştirel biçimde okuyabilir, yorumlayabilir ve çözümleyebilir.
7 Çin kültürünü şekillendiren başlıca düşünce gelenekleri, inanç sistemleri, estetik anlayışlar ve tarihsel olaylar hakkında ileri düzey bilgi sahibi olur.
8 Alanındaki kuramsal yaklaşımlar, eleştiri yöntemleri ve araştırma tekniklerini kullanarak edebî ve kültürel metinleri çözümleyebilir.
9 Çin dili ve edebiyatı alanında kullanılan temel kavram, terim ve yöntemleri bilir; bunları akademik çalışmalarında doğru ve yerinde biçimde uygular.
10 Çince-Türkçe ve Türkçe-Çince çeviri alanında ileri düzey kuramsal ve uygulamalı yetkinlik geliştirir; uzmanlık gerektiren metinlerde çeviri yapabilir.
11 Çin dili, edebiyatı, kültürü ve tarihi alanlarındaki sorunları bilimsel araştırma yöntemleriyle inceleyebilir; bağımsız araştırma tasarlayıp yürüterek bilimsel etik ilkelerine uygun biçimde veri toplama, değerlendirme, karşılaştırma ve sonuçlandırma süreçlerini yönetebilir.
12 Akademik yazım kurallarına uygun olarak açıklayıcı, tartışmacı ve eleştirel nitelikte bilimsel metinler üretebilir.
13 Çin dili ve edebiyatı alanında edindiği çözümleme, yorumlama ve eleştirel düşünme becerilerini medya, sinema, görsel kültür, çeviri, kültürel etkileşim ve benzeri alanlara uygulayabilir.
14 Kültürel farklılıkları nesnel biçimde değerlendirebilir; evrensel değerler, kültürel çeşitlilik, toplumsal sorumluluk ve etik bilinç doğrultusunda hareket eder.
15 Alanındaki bilgi ve becerilerini yaşam boyu öğrenme anlayışıyla geliştirir; akademik ve mesleki gelişimini sürdürebilir.
16 -
17 -
18 -
19 -
20 -
21 -
22 -
23 -
24 -
25 -
26 -
27 -
28 -
29 -
30 -
31 -
32 -
33 -
34 -
35 -
36 -
37 -
38 -
39 -
40 -
41 -
42 -
43 -
44 -
45 -
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 3 14 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 3 14 42
Ödevler 2 14 28
Sunum / Seminer hazırlama 2 14 28
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 14 14
Ara sınavlar 1 1 1
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 2 14 28
Yarıyıl sonu sınavı 1 1 1
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     184
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Allmer, J., 2012. Biyoinformatik I: Dizi Kıyaslamaları. Nobel Yayın Evi, Ankara, 318s.
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar