Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
EMBRİYONİK VE UYARILMIŞ PLURIPOTENT KÖK HÜCRELER Birinci Düzey BİY 524 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı DOÇ. DR. SERVET ÖZCAN
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz Yüze; Dersi alan öğrencilere ilerleyen haftalık konuların ppt sunumları dersten bir hafta önce dağıtılmakta ve internet ortamından yararlanabilecekleri kaynaklar da temin edilmektedir. Ayrıca, konu kapsamında sağlanan dokümantasyonların konular dahilinde sınıf içerisinde tartışılması sağlanmaktadır. Konunun tamamlanması sonrasında, her öğrenciye bireysel ödev konusu verilmektedir. Dersi takip eden haftada, öğrencilerin ödevlerini tartışmasına izin verilmekte ve benzer problemleri çözmeleri konusunda öneriler üretmeleri beklenmektedir.
Dersin Amacı Bu dersin amacı; embriyonik kök hücre ve iPS hücrelerinin oluşumlarını ve özeliklerini öğrenmek, bu alanda bilimsel metodolojiyi anlamak ve derinleşmek, ES ve iPS konularında yayınlanmış kritik makaleleri eleştirel yorumlayabilmek ve rejeneratif tıp uygulamasında hücre tabanlı teknolojilerin kullanımı degerlendirmektir.
Dersin Tanımı Bu ders, özünde embriyonik kök hücre ve iPS hücrelerinin potansiyellerini öğrenerek insan gelişiminde bu hücrelerin rolünü keşfetmektir. Kök hücre çalışmalarının önemli hedeflerinde birisi de hücre farklılaşmasının anlaşılmasıdır. Biyolojik bilimlerde önemli sorulardan birisi; nasıl oluyor da döllenmiş tek yumurta hücresinden 200'den fazla vücudu oluşturan farklı hücre tipleri haline dönüşmekte sorusuna cevap verebilmektir. Bu sorunun anlaşılabilmesi için; 1) çeşitli hücre tiplerinin tanımlanması, 2) primer hücrelerden manipülasyonla farklılaşmış hücrelerin elde edilmesi mümkün olabilmekte sorularının cevaplandırılmasındır. Kurs boyunca, öğrencilerin iPS oluşturulmasında bilim dünyasında kullanılan çeşitli modelleri yarar ve olumsuzlukları açısından tartışmak ve her bir jenerasyon metodolojisini klinik potansiyelleri açısından yararları ve sakıncaları açısından değerlendirmelerine temel oluşturacak bilgi düzeyine ulaştırmaktır.

Dersin İçeriği
1 Tartışma 1: Dersin genel tanımı ve Embiryonik Kök Hücre (ES) hakkında etik konular ve kullanım.
2 Tartışma 2: Tanımı ve tarihçesi bakımından ES nedir?
3 Tartışma 3: Uygulama 1; Hayvan modelinin oluşturulması.
4 Tartışma 4: Hücre farklılaşması, moleküler model.
5 Tartışma 5: Öncül hücre nasıl özelleşir/farklılaşır (devam).
6 Tartıma 6: İlaç araştırmaları ve toksisite testleri.
7 Tartıma 7: Yeni yöntem/teknik: iPS hücresi nedir?
8 Tartışma 8: iPS oluşturulmasında denysel yöntemler; viral vektörlerle transfeksiyon, kromozom integrsayonları.
9 Tartışma 9: iPS oluşturulmasında denysel yöntemler; epizomal vektörlerle transfeksiyon.
10 Tartışma 10: iPS oluşturulmasında denysel yöntemler; mRNA transfeksiyonu, protein uygulamaları.
11 Tartışma 11: iPS generasyonu, pluripotent transisyon, genetic, flow sitometre ve immünosito analizleri.
12 Tartışma 12: Klinik uygulama modelleri
13 Tartışma 13: Ders başlangıcı konularının ES ve iPS hücrelerinin potansiyel ve etik konularının tekrar ziyaret edilmesi.
14 Tartışma 14: Ders başlangıcı konularının ES ve iPS hücrelerinin potansiyel ve etik konularının tekrar ziyaret edilmesi.
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Embiryonik kök hücrenin özelikleri, deneysel yaklaşımları değerlendirmek ve etik bakışı değerlendirebilmek
2 Embiryonik kök hücrenin özeliklerini tanımlamak ve hangi metotlarla laboratuvar ortamında karakterize edilebileceklerini tanımlamak
3 Embiryonik kök hücrenin ilk olarak farede modelinde tanımlanması ve insan hastalıkları modelinde çığır açıcı yaklaşımı sunmasını değerlendirmek
4 Hayvan modelinde transplantasyon sonrası Embiryonik kök hücre sonuçlarını tartışmak
5 Deneysel model systeminde embiryonik kök hücreyi keşfetmek; yararları ve olumsuzlukları değerlendirmek
6 İlaç toksisite çalışmalarında Embiryonik kök hücre kullanımını değerlendirmek: örnek model kalp hücreleri kullanımı
7 Deneysel yaklaşımla (yeniden programlama); iPS
8 Gerçek embiryonik kök hücre kullanımına karşı indüklenmiş (iPS) olumlu ve olumsuzluklarını karşılaştırmak. iPS teknolojisinin bize sunduğu imkanları değerlendirmek
9 İnsan hastalık ve tedavisinde kişi özelinde iPS oluşturulması; transplantasyonu ve hastalık mekanizmalarının anlaşılmasında model uygulamaları değerlendirebilmek
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 İnsan vücudunun temel yapısı, organ ve sistemlerine ait tanım ve terimleri, yerleşimleri, komşulukları ve işleyişleri hakkında bilgi sahiptir.
2 Sağlığın korunması, sistemlere ait hastalıklar ve acil durumlarda ilk yardım bilgisine sahiptir.
3 Ameliyat odasındaki bütün alet ve cihazların periyodik kontrollerini yaptırır.
4 Ameliyat masasının her ameliyattan önce kontrolünü sağlar, hazır hale getirir ve gerekli malzemeleri hazırlar.
5 Ameliyat için hastaya uygun pozisyon verir.
6 Ameliyat sonrasında cerrahi aletlerin, malzemelerin ve ortamın dezenfeksiyonunu sağlayarak yeniden kullanıma hazır hale getirir.
7 Ameliyat sırasında hastadan çıkartılan herhangi bir cerrahi materyalin uygun bir şekilde ilgili birime gönderilmesini sağlar.
8 Cerrahi malzemelerin sterilizasyonunu ve uygun şartlarda muhafaza edilmesini sağlar.
9 Hastanın ameliyat odasına alınmasına ve ameliyat sonrası transportuna yardımcı olur.
10 Cerrahi işlem sırasında hekimin uygun gördüğü durum ve şekilde cerrahi ekibe dahil olur.
11 Kendi alanı ile ilgili teknolojileri kullanır.
12 Birey ve halk sağlığı, iş güvenliği ve çevre koruma konularında yeterli bilince sahiptir.
13 Alanıyla ilgili konularda bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanır ve mesleki bilgilerini yazılı ve sözlü iletişim yoluyla aktarır.
14 Bir yabancı dilde temel düzeyde iletişim kurar ve mesleki uygulamalarda kullanır.
15 Alanı ile ilgili bilgi, beceri ve yetkinlikleri yaşam boyu öğrenme bilinciyle güncelleyip kendini kişisel ve mesleki olarak geliştirir.
16 Alanıyla ilgili temel mesleki yasal mevzuatı anlar. Sosyal, kültürel ve hukuksal hak ve sorumluluklara uygun hareket eder.
17 Kalite yönetimi ve süreçlerine katılır.
18 Diğer sağlık disiplinleri ile çalışır.
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ödevler 2 5 10
Sunum / Seminer hazırlama 2 4 8
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 5 2 10
Ara sınavlar 1 2 2
Proje (Yarıyıl ödevi) 2 5 10
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 10 4 40
Yarıyıl sonu sınavı 1 3 3
Araştırma 4 4 16
Toplam iş yükü     183
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 50
Kısa sınav 0 0
Ödev 2 50
Yarıyıl içi toplam   100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı 1) Web based resources at CiRA, NCBI, EMBO etc. 2) Takahashi, K. et al. 2007. Induction of Pluripotent Stem Cells from Adult Human Fibroblasts by Defined Factors. Cell; 131: pgs 861-872. (Primary) 3) Thomson J.A. et al. 1998. Embryonic Stem Cell Lines Derived from Human Blastocyst. Science; 282: pgs 1145-1147. (Primary) 4) Rippon, H.J. and A.E. Bishop. 2004. Embryonic stem cells. Cell Proliferation; 37: pgs 23-34. (Review) 5) Nusslein-Volhard, C. Gradients that Organize Embryo Development. Scientific American; August 1996: pgs 54-61. (Introduction) 6) Yan, Y. et al. 2005. Directed Differentiation of Dopaminergic Neuronal Subtypes from Human Embryonic Stem Cells. Stem Cells; 23: 781-790. (Primary) 7) Braam, S.R. et al. 2009. Prediction of drug-induced cardiotoxicity using human embryonic stem cell-derived cardiomyocytes. Stem Cell Research; 4: pgs 107-116. (Primary) 8) Colman, A. 2008. Induced Pluripotent Stem Cells and Human Disease. Cell Stem Cell; 3: pgs 236-237. (Preview) 9) Hyun, I. et al. 2007. New Advances in iPS Cell Research Do Not Obviate the Need for Human Embryonic Stem Cells. Cell: Stem Cell; 1: pgs 367-36. (Review) 10) Belmonte, J.C.I. et al. 2009. Induced pluripotent stem cells and reprogramming: seeing the science through the hype. Nature Reviews: Genetics; 10: pgs 878-883.
Yardımcı Kaynaklar Dersi alan öğrencilere ilerleyen haftalık konuların ppt sunumları dersten bir hafta önce dağıtılmakta ve internet ortamından yararlanabilecekleri kaynaklar da temin edilmektedir. Ayrıca, konu kapsamında sağlanan dokümantasyonların konular dahilinde sınıf içerisinde tartışılması sağlanmaktadır.

Ders İle İlgili Dosyalar