Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
PROTEİN PÜRİFİKASYONU	Üçüncü Düzey	TBT 529		2	7.50	7.50	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Yok
Eğitimin Dili	Türkçe
Koordinatör	PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	Prof. Dr. Semih Yılmaz
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Ar. Gör. Ahmet Enes Uray
Dersin Veriliş Şekli	Örgün eğitim (yüz yüze)
Dersin Amacı	Bu dersin amacı gen ve protein ilişkisine bağlantılı olarak proteinlerin hücreden izolasyonunda kullanılan farklı yöntemleri karşılaştırmalı olarak kavratmak ve pürifikasyon işlemlerinde karşılaşılan problemlerle ilgili bilgi vermektir.
Dersin Tanımı	Bu derste protein pürifikasyon kavramları. Yaygın olarak kullanılan yöntemler. Proteinlerin ayrılması işleminde kullanılan faydalı özelliklerinin incelenmesi. Pürifikasyon işlemlerinde göz önünde bulundurulması gereken kilit noktalar. Pürifikasyon işleminde kritik noktalar. Hücre parçalanması, presipitasyon ve antisolvent kristalizasyon. İzoelektrik fokuslama ve 2-D elektroforezi. Protein pürifikasyonunda farklı kromatografik yöntemlerin karşılaştırılması. Endüstriyel ölçekli işlemlerin Maliyet-fayda analizi konuları üzerinde durulacaktır

Dersin İçeriği

1	Pürifikasyon kavramları, Protein pürifikasyonunda yaygın kullanılan yöntemler
2	Proteinlerin ayrılması işleminde kullanılan faydalı özelliklerinin incelenmesi
3	Pürifikasyon işlemlerinde göz önünde bulundurulması gereken kilit noktalar
4	Pürifikasyon işleminde kritik noktalar
5	Hücre parçalanması ve presipitasyon
6	Hücre parçalanması, presipitasyon ve antisolvent kristalizasyon
7	İzoelektrik fokuslama ve 2-D elektroforezi
8	ARA SINAV
9	İzoelektrik fokuslama işlemi ve önemi. 2-DElektroforezi
10	Protein pürifikasyonunda kromatografik yöntemler
11	Protein pürifikasyonunda farklı kromatografik yöntemlerin karşılaştırılması: iyon değişimi kromatografisi
12	Protein pürifikasyonunda farklı kromatografik yöntemlerin karşılaştırılması:afinite kromatografisi, yüksek pergormanslı sıvı kromatografi
13	Endüstriyel ölçekli işlemlerin Maliyet-fayda analizi.
14	FİNAL SINAVI
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Protein pürifikasyonunun temel prensiplerini, kullanılan yöntemleri ve proteinlerin ayrılmasında yararlanılan fizikokimyasal özellikleri ileri düzeyde açıklayabilme.
2	Hücre parçalanması, presipitasyon ve antisolvent kristalizasyon gibi ön ayırma tekniklerinin çalışma prensiplerini analiz edebilme ve uygun koşulları belirleyebilme.
3	Protein pürifikasyon süreçlerinde kritik parametreleri (pH, sıcaklık, iyonik güç, stabilite vb.) değerlendirebilme ve deneysel süreçleri optimize edebilme.
4	İzoelektrik fokuslama ve iki boyutlu elektroforez tekniklerinin prensiplerini açıklayabilme, elde edilen sonuçları yorumlayabilme ve proteomik analizlerde kullanımını değerlendirebilme.
5	Protein pürifikasyonunda kullanılan kromatografik yöntemleri (iyon değişimi, afinite kromatografisi, yüksek performanslı sıvı kromatografi vb.) karşılaştırabilme ve uygun yöntemi seçebilme.
6	Protein pürifikasyon süreçlerini araştırma ve endüstriyel üretim bağlamında değerlendirebilme, süreç tasarımı yapabilme ve maliyet–fayda analizi gerçekleştirebilme.
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	13	3	39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	13	3	39
Ödevler	2	8	16
Sunum / Seminer hazırlama	3	5	15
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	8	8
Ara sınavlar	1	4	4
Proje (Yarıyıl ödevi)	2	10	20
Laboratuvar	3	6	18
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	1	10	10
Yarıyıl sonu sınavı	1	5	5
Araştırma	1	10	10
Toplam iş yükü			184
AKTS			7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	30
Kısa sınav	0	0
Ödev	1	10
Yarıyıl içi toplam		40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	Robert K. Scopes - 1994 . Protein Purification: Principles and Practice. Paul Cutler - 2004 Protein Purification Protocols. Michael R. Ladisch. 1990. Protein purification: from molecular mechanisms to large-scale.
Yardımcı Kaynaklar	Protein purification applications.Second Edition. A Practical Approach. Edited by Simon Roe, AEA Technology plc, Bioprocessing Facility,Transport Way, Watlington Road,Oxford 0X4 6LY, U.K.

Ders İle İlgili Dosyalar