Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEİN PÜRİFİKASYONU Birinci Düzey TBT 529 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı Prof. Dr. Semih Yılmaz
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Ar. Gör. Ahmet Enes Uray
Dersin Veriliş Şekli Örgün eğitim (yüz yüze)
Dersin Amacı Bu dersin amacı gen ve protein ilişkisine bağlantılı olarak proteinlerin hücreden izolasyonunda kullanılan farklı yöntemleri karşılaştırmalı olarak kavratmak ve pürifikasyon işlemlerinde karşılaşılan problemlerle ilgili bilgi vermektir.
Dersin Tanımı Bu derste protein pürifikasyon kavramları. Yaygın olarak kullanılan yöntemler. Proteinlerin ayrılması işleminde kullanılan faydalı özelliklerinin incelenmesi. Pürifikasyon işlemlerinde göz önünde bulundurulması gereken kilit noktalar. Pürifikasyon işleminde kritik noktalar. Hücre parçalanması, presipitasyon ve antisolvent kristalizasyon. İzoelektrik fokuslama ve 2-D elektroforezi. Protein pürifikasyonunda farklı kromatografik yöntemlerin karşılaştırılması. Endüstriyel ölçekli işlemlerin Maliyet-fayda analizi konuları üzerinde durulacaktır

Dersin İçeriği
1 Pürifikasyon kavramları, Protein pürifikasyonunda yaygın kullanılan yöntemler
2 Proteinlerin ayrılması işleminde kullanılan faydalı özelliklerinin incelenmesi
3 Pürifikasyon işlemlerinde göz önünde bulundurulması gereken kilit noktalar
4 Pürifikasyon işleminde kritik noktalar
5 Hücre parçalanması ve presipitasyon
6 Hücre parçalanması, presipitasyon ve antisolvent kristalizasyon
7 İzoelektrik fokuslama ve 2-D elektroforezi
8 ARA SINAV
9 İzoelektrik fokuslama işlemi ve önemi.
10 2-DElektroforezi
11 Protein pürifikasyonunda kromatografik yöntemler
12 Protein pürifikasyonunda kromatografik yöntemler
13 Protein pürifikasyonunda farklı kromatografik yöntemlerin karşılaştırılması: iyon değişimi kromatografisi
14 Protein pürifikasyonunda farklı kromatografik yöntemlerin karşılaştırılması:afinite kromatografisi, yüksek pergormanslı sıvı kromatografi
15 Endüstriyel ölçekli işlemlerin Maliyet-fayda analizi.
16 FİNAL SINAVI
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Protein pürifikasyonunun temel prensiplerini, kullanılan yöntemleri ve proteinlerin ayrılmasında yararlanılan fizikokimyasal özellikleri ileri düzeyde açıklayabilme.
2 Hücre parçalanması, presipitasyon ve antisolvent kristalizasyon gibi ön ayırma tekniklerinin çalışma prensiplerini analiz edebilme ve uygun koşulları belirleyebilme.
3 Protein pürifikasyon süreçlerinde kritik parametreleri (pH, sıcaklık, iyonik güç, stabilite vb.) değerlendirebilme ve deneysel süreçleri optimize edebilme.
4 İzoelektrik fokuslama ve iki boyutlu elektroforez tekniklerinin prensiplerini açıklayabilme, elde edilen sonuçları yorumlayabilme ve proteomik analizlerde kullanımını değerlendirebilme.
5 Protein pürifikasyonunda kullanılan kromatografik yöntemleri (iyon değişimi, afinite kromatografisi, yüksek performanslı sıvı kromatografi vb.) karşılaştırabilme ve uygun yöntemi seçebilme.
6 Protein pürifikasyon süreçlerini araştırma ve endüstriyel üretim bağlamında değerlendirebilme, süreç tasarımı yapabilme ve maliyet–fayda analizi gerçekleştirebilme.
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Heykel sanatını çağın dinamikleriyle beraber düşünür, yaratıcı ve özgün eserler ortaya koyar.
2 Heykel sanatında geleneksel malzeme/teknikleri tanır ve uygulamalı olarak bilir.
3 Sanat ve heykel sanatıyla ilgili ulusal ve uluslararası gelişmeleri takip eder.
4 Heykel eğitimindeki yöntem ve yaklaşımların gelişimini ve dönüşümünü, diğer disiplinler ile ilişki kurarak değerlendirir.
5 Edindiği sanat kültürü ve eğitimi ile ortaya koyduğu özgün eserlerle, toplumun sanat düşüncesine katkıda bulunur.
6 Alanı ile ilgili terminolojiyi bilir. Buna uygun olarak sanatsal ifade biçimlerini doğru ve etkili olarak kullanır.
7 Alanıyla ilgili teknolojik gelişmeleri takip eder ve bunları uygulama sürecinde etkili olarak kullanır.
8 Bir sanat projesini geliştirme, planlama ve uygulama becerisine sahip olur.
9 Diğer meslek alanlarında ve sosyal konularda oluşturulan ekip çalışmalarında etkin olarak yer alır ve sorumluluk üstlenir.
10 Demokrasiye ve insan haklarına, toplumsal, bilimsel, kültürel değerlere ve mesleki etik ilkelere uygun davranır.
11 Mesleki bilgi ve becerilerini sürekli olarak geliştirir.
12 Diğer sanat disiplinleri ile ilgili uygulamaları da asgari düzeyde kullanır.
13 Temel sanat prensiplerini tanır ve kompozisyon içerisinde kullanarak analitik düşünce becerisi kazanır.
14 Etkin bir şekilde görsel, yazılı ve sözlü iletişim kurar.
15 Mesleki uygulamalarda etik sorumlulukları kavrar, benimser ve uygular.
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 13 3 39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 13 3 39
Ödevler 2 8 16
Sunum / Seminer hazırlama 3 5 15
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 8 8
Ara sınavlar 1 4 4
Proje (Yarıyıl ödevi) 2 10 20
Laboratuvar 3 6 18
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 10 10
Yarıyıl sonu sınavı 1 5 5
Araştırma 1 10 10
Toplam iş yükü     184
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 30
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 10
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Robert K. Scopes - 1994 . Protein Purification: Principles and Practice. Paul Cutler - 2004 Protein Purification Protocols. Michael R. Ladisch. 1990. Protein purification: from molecular mechanisms to large-scale.
Yardımcı Kaynaklar Protein purification applications.Second Edition. A Practical Approach. Edited by Simon Roe, AEA Technology plc, Bioprocessing Facility,Transport Way, Watlington Road,Oxford 0X4 6LY, U.K.

Ders İle İlgili Dosyalar