Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
BİYOİNFORMATİK VE DOKU MÜHENDİSLİĞİ Birinci Düzey SCR 514 1 8.00 8.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı YRD.DOÇ. DR. YAGUT AKBAROVA
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu dersin amacı, bir dizi ders ve laboratuvar uygulamaları yoluyla Bioinformatik ile ilgili temel kavramları öğrencilere öğretmek ve bilgi sahibi yapmaktır
Dersin Tanımı Bu ders, biyoinformatik araştırmalarda kullanılan en önemli ve temel kavramları, yöntemleri ve araçları tanıtmak için tasarlanmıştır. Konular biyoinformatik veritabanlarını, dizi ve yapı hizalama, protein yapı tahmini, protein katlanması, protein-protein etkileşimlerini içerir.

Dersin İçeriği
1 Biyoinformatiğe giriş
2 Biyolojik veritabanları
3 Özel veritabanları
4 Sekans analizleri
5 Lokal hizalama, BLAST
6 Global hizalama, Clustal
7 Filogenetik ağaçlar
8 Gen bulma ve sekans annotasiyonu
9 SNP annotasyonu ve değerlendirilmesi
10 Promotör elemanlarının bulunması ve analizi
11 Protein veritabanları
12 Protein yapılarının 3D görüntüleme araçları
13 İlaç veritabanları
14 İlaçların hedef genleri, transporterleri ve metabolize eden enzimler
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Biyolojik veri tabanları
2 Veri tabanlarındaki bilgilerin annotasyonu
3 Genler ve hastalıklar hakkında bilgi edinme
4 DNA ve Protein dizilerinin analizi
5 Genler ve ilaçlar hakkında bilgi edinme
6 Genler ve yolaklar hakkında bilgi edinme
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Japonca okuma-yazma, dinleme-konuşma becerilerini ileri düzeyde geliştirir. Ulusal ve uluslararası platformlarda, kendisini etkili bir şekilde yazılı ve sözlü olarak ifade edebilecek Japonca dil yeterliğini kazanır.
2 Japon Edebiyatına ait farklı türden eserleri; bu eserlerin tarihi, kültürel ve sosyal bağlamını öğrenir.
3 Japon dilinin yapısını, özelliklerini ve gelişimini öğrenir. Dilbilgisi, ses bilgisi, söz-dizim, anlambilim, konularında yetkinlik kazanır.
4 Japoncadan Türkçeye, Türkçeden Japoncaya farklı alanlardan her seviyede metinleri tercüme edebilecek bilgi ve yetkinliğe sahip olur.
5 Dilbilgisi, edebiyat eleştirisi ve metin çevirisi gibi alanlarda yeterli bilgi ve birikime sahip olur. Edindiği kuramsal ve uygulamalı bilgileri ilgili alanlarda da kullanabilecek yetkinliğe sahiptir.
6 Mesleği ile ilgili alanlarda karşılaşılan problemleri tanımlar ve bu konuda beklentileri karşılayacak çözümler geliştirir. Karşılaşılan problemlerin çözümü için ilgili kurumlar ile iş birliği yapma ve çözüm geliştirme becerisi kazanır.
7 Mesleki etik ve sorumluluk bilinci gelişir.
8 Disiplinler arası bilgi birikim ve bakış açısı kazanır. Dil ve edebiyat çalışmalarının farklı diğer disiplinler ile ilişkisini öğrenir. Disiplinler arası bilgisini ve birikimini kullanabilecek yetkinliğe sahip olur.
9 Edebiyat kuramlarını bilir. Eleştirel ve analitik düşünme becerisi geliştirir. Sahip olduğu kuramsal bilgiyi ve eleştirel birikimi etkili olarak kullanır.
10 Bireysel olarak ve grup içinde uyumlu çalışır. Mesleği ile ilgili proje geliştirme ve uygulama becerisi kazanır.
11 Mesleğine özgün birikimi kullanarak kültürel farklılıkları dikkate alan, evrensel standartlara uygun karşılaştırmalı bir araştırma, eğitim ve öğretim anlayışı geliştirir.
12 Mesleki ve bireysel alanlarda yaşam boyu öğrenme becerisine ve yetkinliğine sahip olur.
13 Edebiyat kültürü içinde çevre, ırk, cinsiyet, din ve ekonomik konularda bilgi ve anlayış sahibi olur. Bu konularda topluma bilgi, birikim ve düşünce olarak katkı sağlayabilecek farkındalık geliştirir.
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 30 2 60
Ödevler 20 2 40
Sunum / Seminer hazırlama 1 2 2
Kısa sınavlar 3 1 3
Ara sınavlara hazırlık 2 2 4
Ara sınavlar 1 3 3
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 14 2 28
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 3 2 6
Yarıyıl sonu sınavı 1 3 3
Araştırma 3 1 3
Toplam iş yükü     194
AKTS     8.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 50
Kısa sınav 0 0
Ödev 3 50
Yarıyıl içi toplam   100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   50
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   50
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Bioinformatics For Dummies, 2nd Edition Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame ISBN: 978-0-470-08985-9
Yardımcı Kaynaklar Bioinformatics for Geneticists, Michael Barnes, Ian C Gray ISBN: 0-470-84394-2

Ders İle İlgili Dosyalar