Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
BİYOİNFORMATİK VE DOKU MÜHENDİSLİĞİ	İkinci Düzey	SCR 514	Seçmeli	1	8.00	8.00	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Yok
Eğitimin Dili	Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	YRD.DOÇ. DR. YAGUT AKBAROVA
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Yok
Dersin Veriliş Şekli	Yüz yüze
Dersin Amacı	Bu dersin amacı, bir dizi ders ve laboratuvar uygulamaları yoluyla Bioinformatik ile ilgili temel kavramları öğrencilere öğretmek ve bilgi sahibi yapmaktır
Dersin Tanımı	Bu ders, biyoinformatik araştırmalarda kullanılan en önemli ve temel kavramları, yöntemleri ve araçları tanıtmak için tasarlanmıştır. Konular biyoinformatik veritabanlarını, dizi ve yapı hizalama, protein yapı tahmini, protein katlanması, protein-protein etkileşimlerini içerir.

Dersin İçeriği

1	Biyoinformatiğe giriş
2	Biyolojik veritabanları
3	Özel veritabanları
4	Sekans analizleri
5	Lokal hizalama, BLAST
6	Global hizalama, Clustal
7	Filogenetik ağaçlar
8	Gen bulma ve sekans annotasiyonu
9	SNP annotasyonu ve değerlendirilmesi
10	Promotör elemanlarının bulunması ve analizi
11	Protein veritabanları
12	Protein yapılarının 3D görüntüleme araçları
13	İlaç veritabanları
14	İlaçların hedef genleri, transporterleri ve metabolize eden enzimler
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Biyolojik veri tabanları
2	Veri tabanlarındaki bilgilerin annotasyonu
3	Genler ve hastalıklar hakkında bilgi edinme
4	DNA ve Protein dizilerinin analizi
5	Genler ve ilaçlar hakkında bilgi edinme
6	Genler ve yolaklar hakkında bilgi edinme
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	14	3	42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	30	2	60
Ödevler	20	2	40
Sunum / Seminer hazırlama	1	2	2
Kısa sınavlar	3	1	3
Ara sınavlara hazırlık	2	2	4
Ara sınavlar	1	3	3
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	14	2	28
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	3	2	6
Yarıyıl sonu sınavı	1	3	3
Araştırma	3	1	3
Toplam iş yükü			194
AKTS			8.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	50
Kısa sınav	0	0
Ödev	3	50
Yarıyıl içi toplam		100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		50
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		50
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	Bioinformatics For Dummies, 2nd Edition Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame ISBN: 978-0-470-08985-9
Yardımcı Kaynaklar	Bioinformatics for Geneticists, Michael Barnes, Ian C Gray ISBN: 0-470-84394-2

Ders İle İlgili Dosyalar