Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEİN YAPISI VE FONKSİYONLARI Birinci Düzey TBT 305 5 4.00 4.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı Semih Yılmaz
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Kevser Karaman, Ahmet Say
Dersin Veriliş Şekli Örgün(Yüz Yüze)
Dersin Amacı Gen-protein ilişkisini ve biyoteknolojide proteinlerin önemini kavratma.
Dersin Tanımı Bu ders öğrencilerin proteomikteki temel konuları kavraması ve tarımda kullanım alanlarını öğrenmesi için düzenlenmiştir

Dersin İçeriği
1 Proteomik ve porteom
2 Analitik proteomiğe genel bakış. Kantitatif proteomik
3 Analitik protein ve peptid ayrımı
4 Protein ve peptid analizinde kütle spektrofotometrisi
5 Peptid kütle parmakizi ile protein tanımlama. Protein modifikasyon proteomiği
6 Proteomik'te yeni yönelimler
7 Tandem Kütle Spektrometre Verilerle Protein Tanımlama
8 ARA SINAV
9 Proteomik uygulamaları
10 Protein ifade profili
11 Protein-protein ilişkisi belirleme ve protein kompleksleri
12 Tandem kütle spektrometresi ile peptid Dizi Analizi
13 Biyoinformatik araçları
14 YARIYIL SONU SINAVI
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Proteomikteki pratik ve teorik konuları bilir
2 Proteinlerin büyük ölçekli analizi için ortak iş akışlarını bilir
3 Proteom ölçümü ile ilgili temel konuları bilir
4 Kütle spektrometresi verinin proteinleri tespit etmek için kullanımını anlar
5 De novo dizileme ile birlikte MS / MS verilerini değerlendirebilir
6 Post-translasyonel modifikasyonlar ve protein-protein etkileşimlerinin analizini yapabilir
7 Protein katlanmasını bilir
8 Fonksiyonel proteinlerde birden fazla tersiyer yapı olabileceğini bilir
9 Fonksiyonel proteinleri gruplandırabilir
10 Gen-protein ilişkisini ve gen dizilerinin proteinin primer-quaterner yapısında etkili olduğunu bilir

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 İktisadi konular ile ilgili temel kavramları ve ekonomik göstergeleri açıklar.
2 İktisadi olayları, kavram ve teorileri kullanarak açıklar.
3 İktisadi teorilerin ve modellerin işleyişini açıklar ve uygun analiz araçları ile test eder.
4 İktisadi düşüncenin gelişimi ve modern düşünce sistemi içindeki yerini karşılaştırmalı olarak analiz eder ve açıklar.
5 Nitel ve nicel analiz yöntemleri ve araçları veri toplama, analiz etme ve yorumlamada kullanır.
6 Sayısal, sözel ve grafik halinde sunulan iktisadi bilgileri açıklar.
7 İktisadi konularda edindiği bilgi ve becerileri yazılı, sözlü ve görsel araçları kullanarak aktarır.
8 İktisat alanında bir yabancı dili kullanır ve yabancı literatürü takip eder.
9 Karşılaşılması öngörülmeyen karmaşık iktisadi durumlarda, yeni yaklaşımlar geliştirir ve çözüm üretebilir.
10 Bölgesel, ulusal ve küresel ölçekte karşılaşılan iktisadi sorunları analiz eder ve çözüm önerileri geliştirir.
11 İktisat alanının gerektirdiği düzeyde bilgisayar yazılımı ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini ileri düzeyde kullanır.
12 Bağımsız ve özgün araştırma yapar ve alanındaki temel birincil kaynaklara ulaşır.
13 İktisat ile ilgili alt dallarda uzmanlaşır ve diğer sosyal bilimler alanları ile ilişki kurarak disiplinler arası analiz yapar.
14 Demokrasi, insan hakları, toplumsal ve bilimsel değerler ile mesleki etik ilkelerine uygun davranır.
15 İş hayatında karşılaşılan hukuksal sorunları çözer.
16 Sermaye piyasaları ile finansal teknikler konusunda sahip olduğu bilgileri kullanarak piyasalardaki gelişmeleri takip eder.
17 Ekonomideki karar birimlerinin davranışlarını bütüncül bir yaklaşımla analiz eder.
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 13 3 39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 13 2 26
Ödevler 2 3 6
Sunum / Seminer hazırlama 1 3 3
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 8 8
Ara sınavlar 1 2 2
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 6 1 6
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 5 5
Yarıyıl sonu sınavı 1 2 2
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     97
AKTS     4.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 30
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 10
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Amit Kessel, Nir Ben-Tal. Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion, Second Edition. 2018
Yardımcı Kaynaklar Gregory Petsco. Protein Structure and Function. 2004

Ders İle İlgili Dosyalar