Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEİN YAPISI VE FONKSİYONLARI Üçüncü Düzey TBT 305 5 4.00 4.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı ARŞ. GÖR. AHMET ENES URAY
Dersin Veriliş Şekli Örgün(Yüz Yüze)
Dersin Amacı Gen-protein ilişkisini ve biyoteknolojide proteinlerin önemini kavratma.
Dersin Tanımı Bu ders öğrencilerin proteomikteki temel konuları kavraması ve tarımda kullanım alanlarını öğrenmesi için düzenlenmiştir

Dersin İçeriği
1 Proteomik ve porteom
2 Analitik proteomiğe genel bakış. Kantitatif proteomik
3 Analitik protein ve peptid ayrımı
4 Protein ve peptid analizinde kütle spektrofotometrisi
5 Peptid kütle parmakizi ile protein tanımlama. Protein modifikasyon proteomiği
6 Proteomik''te yeni yönelimler
7 Tandem Kütle Spektrometre Verilerle Protein Tanımlama
8 ARA SINAV
9 Proteomik uygulamaları
10 Protein ifade profili, normal şartlara göre
11 Protein ifade profili, ekstrem şartlara göre
12 Protein kompleksleri
13 Protein-protein ilişkisi belirleme ve protein kompleksleri
14 Tandem kütle spektrometresi ile peptid Dizi Analizi
15 Biyoinformatik araçları
16 YARIYIL SONU SINAVI
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Proteomikteki pratik ve teorik konuları bilir
2 Proteinlerin büyük ölçekli analizi için ortak iş akışlarını bilir
3 Proteom ölçümü ile ilgili temel konuları bilir
4 Kütle spektrometresi verinin proteinleri tespit etmek için kullanımını anlar
5 De novo dizileme ile birlikte MS / MS verilerini değerlendirebilir
6 Post-translasyonel modifikasyonlar ve protein-protein etkileşimlerinin analizini yapabilir
7 Protein katlanmasını bilir
8 Fonksiyonel proteinlerde birden fazla tersiyer yapı olabileceğini bilir
9 Fonksiyonel proteinleri gruplandırabilir
10 Gen-protein ilişkisini ve gen dizilerinin proteinin primer-quaterner yapısında etkili olduğunu bilir

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Veteriner parazitoloji alanındaki güncel bilgilere sahip olmak ve uzmanlık eğitimine hazır olabilmek.
2 Veteriner parazitoloji alanındaki güncel uygulamaları yapabilmek.
3 Bağımsız olarak ve ayrıca çalışma ekibinin lideri ve bir üyesi olarak sorumluluk alabilmek, planlama yapabilmek, çalışabilmek, karşılaşılan sorunları çözebilmek.
4 Yaşam boyu öğrenme ile ilişkili olarak sağlık alanındaki yeni bilgilere ulaşabilmek, değerlendirebilmek ve uygulayabilmek.
5 Yabancı dili de kullanarak sağlık alanında yurt içinde ve yurt dışındaki meslektaşları ile iletişim kurabilmek.
6 Sağlık alanındaki verileri toplayabilmek, değerlendirebilmek ve kalite yönetimi sürecine uygun hareket edebilmek.
7 Veteriner parazitoloji alanındaki spesifik bilgilere sahip olmak.
8 Veteriner parazitoloji alanındaki deneysel uygulamaları yapabilmek.
9 Veteriner parazitoloji alanındaki edinilen bilgileri sentezleyip, yeni fikirler oluşturabilmek.
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 13 3 39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 13 2 26
Ödevler 2 3 6
Sunum / Seminer hazırlama 1 3 3
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 8 8
Ara sınavlar 1 2 2
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 6 1 6
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 5 5
Yarıyıl sonu sınavı 1 2 2
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     97
AKTS     4.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 30
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 10
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Amit Kessel, Nir Ben-Tal. Introduction to Proteins: Structure, Function, and Motion, Second Edition. 2018
Yardımcı Kaynaklar Gregory Petsco. Protein Structure and Function. 2004

Ders İle İlgili Dosyalar