Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
BİYOİNFORMATİK İkinci Düzey TBT 511 1 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu dersin amacı, öğrencilerin biyoenformatik alanına hızla ulaşmalarına yardımcı olmak ve kendi araştırma alanlarındaki problemleri çözmek için biyoenformatik araçları kullanabilmelerini sağlamaktır.
Dersin Tanımı Biyoinformatik dersi biyoinformatikte kullanılan en önemli ve temel kavramları, yöntemleri ve araçları tanıtmak üzere tasarlanmıştır. Bu ders biyolojik bilimlerde yeni ve hızla gelişen biyoinformatik alanına titiz, disiplinler arası bir yaklaşım sağlamaktadır. Ayrıca biyolojik veriler, genom evrimi ve varyasyonları ve biyolojik veri tabanlarının düzenlenmesi, analizi, karşılaştırılması ve anatasyonunda faydalı bilgiler sunacaktır.

Dersin İçeriği
1 Biyoinformatikte kullanılan en önemli ve temel kavramlar, yöntemler ve araçlara giiriş
2 Nükleotid dizi veritabanlarına giriş
3 Protein dizi veritabanları
4 Sanger ve yeni nesil sekanslama teknolojileri
5 Pairwise sekans alignment ve veritabanı araması
6 Patern, Profil ve Multiple sekans alignment ve algoritmalar
7 Örnek çalışma
8 Ara Sınav
9 Veri tabanına sekans veri girişi
10 Genom varyasyon ve evrim araştırmaları
11 Biyolojik dizilerin anatasyonu
12 Filogenetik ve filogenomik analizler
13 Gen ifadesi ve DNA mikroarrayler
14 Örnek çalışma
15 Örnek çalışma
16 Final Sınavı
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Öğrenciler genom biyoinformatik araçlarını kullanabilecektir.
2 Öğrenciler genom biyoinformatikde kullanılan en önemli ve temel kavram, yöntem ve araçları anlayacaklardır.
3 Bu ders biyolojik bilimlerde yeni ve hızla gelişen genom biyoinformatik alanında titiz, disiplinler arası bir bilgi sunmaktadır.
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Alanındaki bilgileri uzmanlık düzeyinde kullanır.
2 Alanında elde ettiği bilgileri farklı disiplinlerle bütünleştirerek yorumlar.
3 Verilerin toplanması, analiz edilmesi, yorumlanması ve duyurulması aşamalarında toplumsal, bilimsel, kültürel ve etik değerleri dikkate alarak bilimsel çalışma yapar.
4 Yaptığı bilimsel araştırmaların sonuçlarını sözlü ve yazılı olarak aktarır.
5 Analitik düşünme yeteneğini geliştirerek gerçek hayat problemlerini çözer.
6 Etkin bir yönetim için kullanılabilecek çeşitli karar-destek tekniklerini uygular.
7 İşletme paydaşlarının davranışlarının nedenlerini, oluşum süreçlerini ve sonuçlarını açıklar.
8 Günümüz işletmelerinde uygulanabilecek çağdaş yönetim tekniklerini ve bunların uygulanma gerekçelerini teorik alt yapılarını ve bağlamsal koşulları dikkate alarak listeler ve açıklar.
9 İşletmelerin iç ve dış unsurlarıyla uyumlu, esnekliğini ve rekabet gücünü artıracak stratejik yönetim süreçlerini tasarlar ve uygular.
10 Pazarlama alanında farklı konuları algılar ve disiplinlerarası çalışmalarda kullanır.
11 Muhasebe ve finansman alanında işletmenin karşılaşabileceği tüm sorunları tespit eder ve çözer.
12 Finansal verileri analiz edecek programları kullanır.
13 Alanındaki ulusal ve uluslararası gelişmeleri takip eder ve tartışır.
14 Üretim ve hizmet işletmelerinin lojistik ve stoklama faaliyetlerini etkin yönetir.
15 İşletmelerin kaynaklarını verimli kullanması için gereken düzenlemeleri listeler.
16 İşletmenin herhangi bir alanında karşılaştığı problemi matematiksel bir model ile ifade eder ve farklı yöntemlerle çözer.
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 3 14 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 3 14 42
Ödevler 2 14 28
Sunum / Seminer hazırlama 2 14 28
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 14 14
Ara sınavlar 1 1 1
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 2 14 28
Yarıyıl sonu sınavı 1 1 1
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     184
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Allmer, J., 2012. Biyoinformatik I: Dizi Kıyaslamaları. Nobel Yayın Evi, Ankara, 318s.
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar