Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
INTRODUCTION TO COMPUTATIONAL MOLECULAR PHYSICS İkinci Düzey PHYS556 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri -
Eğitimin Dili İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı PROF. DR. ERHAN ALBAYRAK
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı -
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu dersin amacı hesapsal moleküler fiziğin modern metodlarını ve uygulamalarını öğrencilere tanıtmaktır.
Dersin Tanımı İlk prensipler (kuantum mekanik tababnlı) metodları fizik, kimya, biyoloji ve malzeme biliminin ilgi duyduğu moleküler sistemlerin elektronik yapıları ve fiziksel özellikleri kakkında önemli ipuçları verir. Diğer yandan, moleküler dinamik moleküler bir sistemin zamana bağlı davranışının Newton''''un hareket denlemlerinin nümerik çözülerek elde edildiği hesapsal bir yöntemdir. Bu seçmeli ders, hesapsal elektronik yapının ve moleküler dinamiğin temel prensiplerine bir giriş yapmaktadır.

Dersin İçeriği
1 Many Electron Wave Functions and Operators
2 The Born-Oppenheimer Approximation
3 Hartree-Fock (HF) Theory
4 Interpretation of Solutions to the Hartree-Fock Equations
5 The Structure of a Hartree-Fock Computer Program
6 Paper Presentations
7 Midterm Exam
8 Second-order Moller-Plesset Perturbation (MP2) Theory
9 Kohn-Sham Density Functional Theory (KS-DFT)
10 Some Illustrative Electronic Structure Calculations
11 Paper Presentations
12 Classical Molecular Dynamics
13 MD Simulation of Liquid Water
14 Final Exam
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Moleküler Hamiltonien''in terimlerini anlamak
2 Dalga fonksiyonu bazlı elektronik yapı yöntemlerinin temel prensiplerini öğrenmek
3 Hartree-Fock Teorisini ve limitlerini anlamak
4 MP2 ve DFT gibi Post-Hartree-Fock elektronik yapı yöntemlerini öğrenmek
5 Moleküler dinamik simülasyonlarının prensiplerini anlamak
6 Araştırılan konuları sunabilmek
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 veteriner fizyoloji alanındaki güncel bilgilere sahip olmak ve uzmanlık eğitimine hazır olabilmek
2 veteriner fizyoloji alanındaki güncel uygulamaları yapabilmek
3 Bağımsız olarak ve ayrıca çalışma ekibinin lideri ve bir üyesi olarak sorumluluk alabilmek, planlama yapabilmek, çalışabilmek, karşılaşılan sorunları çözebilmek
4 Yaşam boyu öğrenme ile ilişkili olarak sağlık alanındaki yeni bilgilere ulaşabilmek, değerlendirebilmek ve uygulayabilmek
5 Yabancı dili de kullanarak sağlık alanında yurt içinde ve yurt dışındaki meslektaşları ile iletişim kurabilmek
6 Sağlık alanındaki verileri toplayabilmek, değerlendirebilmek ve kalite yönetimi sürecine uygun hareket edebilmek
7 veteriner fizyoloji alanındaki spesifik bilgilere sahip olmak
8 veteriner fizyoloji alanındaki deneysel uygulamaları yapabilmek
9 veteriner fizyoloji alanındaki edinilen bilgileri sentezleyip, yeni fikirler oluşturabilmek
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ödevler 6 7 42
Sunum / Seminer hazırlama 2 8 16
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 20 20
Ara sınavlar 1 2 2
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 20 20
Yarıyıl sonu sınavı 1 2 2
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     186
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 6 60
Yarıyıl içi toplam   100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   70
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   30
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Modern Quantum Chemistry (A. Szabo, N.S. Ostlund) Understanding Molecular Simulation: From Algorithms to Applications (Computational Science) (D. Frenkel, B. Smit)
Yardımcı Kaynaklar -

Ders İle İlgili Dosyalar