Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION Birinci Düzey AGS 540 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Arş. Gör. Ahmet Enes URAY
Dersin Veriliş Şekli Teorik yüzyüze eğitim
Dersin Amacı Bu ders; Proteinlerin genlerde kodlanmış amino asit kodonlarından yapısal bütünlüğünün nasıl oluştuğunu; Yapısal ve işlevsel farklılıklarını; Büyük çeşitliliğinin sebepleri; Organizmalarda çeşitli kullanım alanları; ve analiz yöntemlerini kavratmayı amaçlar
Dersin Tanımı Bu ders protein yapılarının detaylı yönlerini ve ayrıca bu yapıların işlevleriyle nasıl ilişkili olduğunu kapsar. Ele alınacak konular şunlardır; Analiz edilen protein sınıfları; Protein yapısı ve kimyası; Amino asit sınıfları ve özellikleri; Yan zincir modifikasyonları; Proteinlerin sınıflandırılması; Protein katlama, modifikasyon ve degredasyonu; Protein fonksiyonları; Protein yapılarının belirlenmesi; Protein yapısını ve fonksiyonunu incelemek için veri ve teknolojilerin uygulamaları

Dersin İçeriği
1 Analiz edilecek protein sınıfları
2 Protein yapısının biyolojisi / kimyası
3 Protein oluşumu
4 Konformasyonel yapıları
5 Protein katlanması, modifikasyonu ve degredasyonu
6 Proteinlerin fonksiyonel tasarımı
7 Protein aktivitesini düzenleyen mekanizmalar; Kimyasal mofidifikasyonlar, bölümlendirmeler
8 Ara sınav
9 Protein etkileşimleri; Protein-protein etkileşimleri
10 Proteinlerin fonksiyonel sınıfları
11 Protein hidrolizi, çözünürlük ve denatürasyon
12 Proteomik uygulamaları
13 Protein analizi için kullanılan yöntemler
14 Elektroforetik ve Kromatogafik yöntemler
15 Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Amino asitlerden proteinlerin nasıl oluştuğunu anlama
2 Bir protein yapısında genler ve amino asit dizileri arasındaki etkileşimi anlama
3 Amino asitler özelliklerine göre kategorize edebilme
4 Proteinleri yapısal özelliklerine göre kategorize edebilme
5 Protein yapısının farklı sınıflandırmalarını ve bu yapı elemanlarının genel yapıyı nasıl etkilediğini anlama
6 Yapısal veya işlevsel açıdan proteinleri ayırt etmek için farklı sınıflandırma şemalarını kullanabilme
7 Protein yapısını aydınlatmak veya tahmin etmek için kullanılan araçları anlama
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Alanındaki bilgileri içeren ders kitapları ve diğer kaynaklarla desteklenen bilgilere sahip olma, sahip olduğu bu bilgileri yazılı ve sözlü olarak aktarabilme, edindiği bilgiyi alanında kullanabilme.
2 Sanat Tarihi araştırma yöntem ve tekniklerini kullanarak sanat eserini tanımlayabilme, sanat eserlerine dini, mitolojik ve ikonografik açıdan bakabilme, analiz ve yorum yapabilme.
3 Bir eserin öz niteliklerinden yola çıkarak dönemin genel özelliklerini ayırt edebilme ve farklı eserler arasında bağlantı kurabilme.
4 Farklı dillerde yer alan epigrafik ve paleografik yazıları okuyabilme ve disiplinler arası çalışma yaparak çözümleyebilme.
5 Bilimsel düşünme becerisi kazanarak analitik düşünebilme.
6 Alanı ile ilgili disiplinler arası etkileşimi kavrayabilme.
7 Alanı ile ilgili belgeleme, restitüsyon ve restorasyon yöntemlerini uygulayabilme, plan, kesit, izdüşümü gibi çizim tekniklerini kullanarak çizim yapabilme.
8 Yaşam boyu öğrenmeyle ilişkili olarak kendini sürekli olarak yenileyebilme
9 Kütüphane, arşiv, internet gibi kaynaklardan yararlanma biçimini öğrenme ve alanı ile ilgili gelişmeleri takip edebilme
10 Alan çalışmalarında arazinin yapısına uygun bir çalışma sistemi kurabilme.
11 Kültür varlıklarını koruma ve onarma ile ilgili edindiği bilgileri çağdaş gereksinimler doğrultusunda uygulayabilme, 2863 sayılı kanun çerçevesinde çalışma disiplini sağlayabilme.
12 Sanat eserlerinin ortaya çıkarılması, müze ve sergi gibi topluma açık ortamlarda sergilenmesine yönelik yöntemleri bilme ve uygulayabilme.
13 Çeşitli coğrafyaların uygarlık ve kültürleri arasında bağlantı kurabilme.
14 Sosyal, kültürel ve toplumsal sorumlulukları kavrama, benimseme ve uygulayabilme becerisi geliştirebilme.
15 İslami dönem Türk sanatının ortaya koyduğu kültürel mirası öğrenme, tanıma ve tanıtma yeteneği kazandırabilme
16 Tarih öncesi devirler dahil, Orta ve yeni çağlar boyunca Avrupa’daki mimari, resim ve heykel konularında bilgilendirme ve değişen üslupları tanıyabilme yeteneği kazandırabilme.
17 Mimari, seramik, halı-kilim vb. dokumalar, minyatür, hat, çini, maden, resim, heykel, kalem işi, sikke ve vb. başlıca Sanat Tarihi konularında bilgilendirebilme.
18 Sanat Tarihi alanında kültürel mirasın evrenselliğine inanarak kültürlere ve değerlere eşit mesafede olabilme.
19 Saha çalışmalarında Sanat Tarihi yöntem ve teknikleri ile bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanabilme.
20 Günümüzde karşılaşılan problemlerden yola çıkarak geçmiş ve bugün arasında bağlantı kurup, geleceğe dair çıkarımlarda bulunabilme.
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 13 3 39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 13 5 65
Ödevler 2 15 30
Sunum / Seminer hazırlama 4 4 16
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 8 8
Ara sınavlar 1 3 3
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 3 5 15
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 10 10
Yarıyıl sonu sınavı 1 3 3
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     189
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 30
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 10
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı protein structure-folding-(Methods in Molecular Biology 168) Kenneth P. Murphy (auth.), Kenneth P. Murphy (eds.) - Protein Structure, Stability, and Folding-Humana Press (2001)
Yardımcı Kaynaklar Johannes Buchner, Thomas Kiefhaber - Protein Folding Handbook. 5-volume set-Wiley-VCH (2005)

Ders İle İlgili Dosyalar