Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION	İkinci Düzey	AGS 540		2	7.50	7.50	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Yok
Eğitimin Dili	İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Arş. Gör. Ahmet Enes URAY
Dersin Veriliş Şekli	Teorik yüzyüze eğitim
Dersin Amacı	Bu ders; Proteinlerin genlerde kodlanmış amino asit kodonlarından yapısal bütünlüğünün nasıl oluştuğunu; Yapısal ve işlevsel farklılıklarını; Büyük çeşitliliğinin sebepleri; Organizmalarda çeşitli kullanım alanları; ve analiz yöntemlerini kavratmayı amaçlar
Dersin Tanımı	Bu ders protein yapılarının detaylı yönlerini ve ayrıca bu yapıların işlevleriyle nasıl ilişkili olduğunu kapsar. Ele alınacak konular şunlardır; Analiz edilen protein sınıfları; Protein yapısı ve kimyası; Amino asit sınıfları ve özellikleri; Yan zincir modifikasyonları; Proteinlerin sınıflandırılması; Protein katlama, modifikasyon ve degredasyonu; Protein fonksiyonları; Protein yapılarının belirlenmesi; Protein yapısını ve fonksiyonunu incelemek için veri ve teknolojilerin uygulamaları

Dersin İçeriği

1	Analiz edilecek protein sınıfları
2	Protein yapısının biyolojisi / kimyası
3	Protein oluşumu
4	Konformasyonel yapıları
5	Protein katlanması, modifikasyonu ve degredasyonu
6	Proteinlerin fonksiyonel tasarımı
7	Protein aktivitesini düzenleyen mekanizmalar; Kimyasal mofidifikasyonlar, bölümlendirmeler
8	Ara sınav
9	Protein etkileşimleri; Protein-protein etkileşimleri
10	Proteinlerin fonksiyonel sınıfları
11	Protein hidrolizi, çözünürlük ve denatürasyon
12	Proteomik uygulamaları
13	Protein analizi için kullanılan yöntemler
14	Elektroforetik ve Kromatogafik yöntemler
15	Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Amino asitlerden proteinlerin nasıl oluştuğunu anlama
2	Bir protein yapısında genler ve amino asit dizileri arasındaki etkileşimi anlama
3	Amino asitler özelliklerine göre kategorize edebilme
4	Proteinleri yapısal özelliklerine göre kategorize edebilme
5	Protein yapısının farklı sınıflandırmalarını ve bu yapı elemanlarının genel yapıyı nasıl etkilediğini anlama
6	Yapısal veya işlevsel açıdan proteinleri ayırt etmek için farklı sınıflandırma şemalarını kullanabilme
7	Protein yapısını aydınlatmak veya tahmin etmek için kullanılan araçları anlama
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	13	3	39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	13	5	65
Ödevler	2	15	30
Sunum / Seminer hazırlama	4	4	16
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	8	8
Ara sınavlar	1	3	3
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	3	5	15
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	1	10	10
Yarıyıl sonu sınavı	1	3	3
Araştırma	0	0	0
Toplam iş yükü			189
AKTS			7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	30
Kısa sınav	0	0
Ödev	1	10
Yarıyıl içi toplam		40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	protein structure-folding-(Methods in Molecular Biology 168) Kenneth P. Murphy (auth.), Kenneth P. Murphy (eds.) - Protein Structure, Stability, and Folding-Humana Press (2001)
Yardımcı Kaynaklar	Johannes Buchner, Thomas Kiefhaber - Protein Folding Handbook. 5-volume set-Wiley-VCH (2005)

Ders İle İlgili Dosyalar