Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEIN STRUCTURE AND FUNCTION Birinci Düzey AGS 540 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Arş. Gör. Ahmet Enes URAY
Dersin Veriliş Şekli Teorik yüzyüze eğitim
Dersin Amacı Bu ders; Proteinlerin genlerde kodlanmış amino asit kodonlarından yapısal bütünlüğünün nasıl oluştuğunu; Yapısal ve işlevsel farklılıklarını; Büyük çeşitliliğinin sebepleri; Organizmalarda çeşitli kullanım alanları; ve analiz yöntemlerini kavratmayı amaçlar
Dersin Tanımı Bu ders protein yapılarının detaylı yönlerini ve ayrıca bu yapıların işlevleriyle nasıl ilişkili olduğunu kapsar. Ele alınacak konular şunlardır; Analiz edilen protein sınıfları; Protein yapısı ve kimyası; Amino asit sınıfları ve özellikleri; Yan zincir modifikasyonları; Proteinlerin sınıflandırılması; Protein katlama, modifikasyon ve degredasyonu; Protein fonksiyonları; Protein yapılarının belirlenmesi; Protein yapısını ve fonksiyonunu incelemek için veri ve teknolojilerin uygulamaları

Dersin İçeriği
1 Analiz edilecek protein sınıfları
2 Protein yapısının biyolojisi / kimyası
3 Protein oluşumu
4 Konformasyonel yapıları
5 Protein katlanması, modifikasyonu ve degredasyonu
6 Proteinlerin fonksiyonel tasarımı
7 Protein aktivitesini düzenleyen mekanizmalar; Kimyasal mofidifikasyonlar, bölümlendirmeler
8 Ara sınav
9 Protein etkileşimleri; Protein-protein etkileşimleri
10 Proteinlerin fonksiyonel sınıfları
11 Protein hidrolizi, çözünürlük ve denatürasyon
12 Proteomik uygulamaları
13 Protein analizi için kullanılan yöntemler
14 Elektroforetik ve Kromatogafik yöntemler
15 Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Amino asitlerden proteinlerin nasıl oluştuğunu anlama
2 Bir protein yapısında genler ve amino asit dizileri arasındaki etkileşimi anlama
3 Amino asitler özelliklerine göre kategorize edebilme
4 Proteinleri yapısal özelliklerine göre kategorize edebilme
5 Protein yapısının farklı sınıflandırmalarını ve bu yapı elemanlarının genel yapıyı nasıl etkilediğini anlama
6 Yapısal veya işlevsel açıdan proteinleri ayırt etmek için farklı sınıflandırma şemalarını kullanabilme
7 Protein yapısını aydınlatmak veya tahmin etmek için kullanılan araçları anlama
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Korece okuma-yazma, dinleme-konuşma becerilerini temel ve/veya ileri düzeyde geliştirir. ulusal ve uluslararası platformlarda, kendisini etkili bir şekilde yazılı ve sözlü olarak ifade edebilecek Korece dil yeterliğini kazanır.
2 Kore Edebiyatı''na ait farklı türden eserleri; bu eserlerin tarihi, kültürel ve sosyal bağlamını öğrenir.
3 Kore dilinin yapısını, özelliklerini ve gelişimini öğrenir. Dil bilgisi, ses bilgisi, söz-dizim, anlam bilim, biçem bilim, söylem bilim ve derlem bilim konularında yetkinlik kazanır.
4 Korece''den Türkçe''ye, Türkçe''den Korece''ye farklı alanlardan her seviyede metinleri tercüme edebilecek bilgi ve yetkinliğe ulaşır.
5 Alanıyla ilgili en son teknolojileri öğrenir. Türkiye ve dünyanın farklı ülkelerinde Korece alanında mesleğini icra edecek bilgi, beceri ve yetkinliğe sahip olur.
6 Dilbilim, yabancı dil öğretimi, edebiyat eleştirisi ve metin çevirisi gibi alanlarda yeterli bilgi ve birikime sahip olur. Edindiği kuramsal ve uygulamalı bilgileri ilgili alanlarda da kullanabilecek yetkinliği kazanır.
7 Mesleği ile ilgili alanlarda karşılaşılan problemleri tanımlar ve bu konuda beklentileri karşılayacak çözümler geliştirir. Karşılaşılan problemlerin çözümü için ilgili kurumlar ile iş birliği yapma ve çözüm geliştirme becerisi kazanır.
8 Disiplinlerarası bilgi birikimi ve bakış açısı kazanır. Disiplinlerarası bilgisini ve birikimini kullanabilecek yetkinliğe sahip olur.
9 Eleştirel ve analitik düşünme becerisi geliştirir. Sahip olduğu kuramsal bilgiyi ve eleştirel birikimi etkili olarak kullanır.
10 Bireysel olarak ve grup içinde uyumlu çalışır. Mesleği ile ilgili proje, inovasyon çalışmaları geliştirme ve uygulama becerisi kazanır.
11 Edebiyat kültürü içinde çevre, ırk, cinsiyet, din ve ekonomik konularda bilgi ve anlayış sahibi olur. Bu konularda topluma bilgi, birikim ve düşünce olarak katkı sağlayabilecek farkındalık geliştirir.
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 13 3 39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 13 5 65
Ödevler 2 15 30
Sunum / Seminer hazırlama 4 4 16
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 8 8
Ara sınavlar 1 3 3
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 3 5 15
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 10 10
Yarıyıl sonu sınavı 1 3 3
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     189
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 30
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 10
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı protein structure-folding-(Methods in Molecular Biology 168) Kenneth P. Murphy (auth.), Kenneth P. Murphy (eds.) - Protein Structure, Stability, and Folding-Humana Press (2001)
Yardımcı Kaynaklar Johannes Buchner, Thomas Kiefhaber - Protein Folding Handbook. 5-volume set-Wiley-VCH (2005)

Ders İle İlgili Dosyalar