Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEİNLERİN İZOLASYONU VE SAFLAŞTIRILMASI Üçüncü Düzey BİK 515 1 8.00 8.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör DR. ÖĞR. ÜYESİ MERVE ÖZEL YETKİN
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı YRD.DOÇ. DR. RECEP SARAYMEN
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Anabilim Dalı Araştırma Görevlileri
Dersin Veriliş Şekli Teorik-pratik
Dersin Amacı Proteinlerin bulundukları biyosistemlerden izolasyonu, diğer moleküllerden ve birbirlerinden ayrılması ve farklı düzeylerde saflaştırılması için izlenecek deneysel yaklaşımları ve uygulanabilecek yöntemleri öğretmek
Dersin Tanımı Bu ders protein izolasyon metodları, saflaştırılan ve çalışılan protein grupları, saflaştırmada kullanılan kromatografik yöntemler, elektroforetik yöntemler, çöktürme yöntemleri, blotlama işlemlerinin açıklanması ve deneysel olarak uygulanması için düzenlendi.

Dersin İçeriği
1 Proteinlerin doğada bulunuşu
2 Biyosistemlerden protein izolasyonu
3 Protein çözeltilerinde derişim
4 Elektroforetik ayırma yöntemleri
5 Poliakrilamid jel elektroforezi
6 İzoelektrik odaklama
7 Membrana aktarım: Blotlama
8 Kromatografik ayırma yöntemleri
9 İyon değişimi kromatografisi
10 Afinite kromatografisi
11 Jel filtrasyonu
12 Protein kristallendirme ve saklama yöntemleri
13 Özel tipte proteinlerin (rekombinant proteinler, membran proteinleri ve antikorlar) saflaştırılması
14
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Belirlenen hedefe yönelik olarak biyolojik objelerden protein saflaştırma stratejisi geliştirebilme .
2 İzolasyon izolasyonu metodlarını acıklama
3 Proteinlerin nicel ve nitel analizini açıklayabilme
4 Biyolojik materyallerden proteinlerin izolasyonda sıklıkla kullanılan kromatografik yöntemleri bilme
5 Kromatografik ve elektroforetik yöntemlerle protein saflaştırma işlemlerini uygulayabilme
6 Kütle MS yönteminin önemini açıklama
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Preklinik ilaç Ar-Ge faaliyetlerini, metodlarını öğrenmek ve süreci yönetebilmek,
2 İlaç Ar-Ge faaliyetlerinde yer alan cihazları kullanabilmek,
3 İlaç uygulama ve araştırma tekniklerini kullanarak yeni ilaç araştırma geliştirme çalışmaları yapabilmek,
4 İlaç Ar-Ge faaliyetinden ürüne dönük sonuçlar elde etmek,
5 Beşeri, veteriner, zirai ve çevre sağlığı ilaç sanayisi ihtiyaçlarına yönelik çalışmak,
6 Kimyasal sentez metodlarını öğrenmek ve sentez aracılığıyla ürün geliştirmek,
7 Biyoinformatik temel prensiplerini öğrenmek ve istatistiksel analizleri yapabilmek,
8 Bitkisel ve diğer kaynaklardan ilaç hammaddesi elde etmek ve bunları formülasyona dönüştürmek,
9 Farmakogenetik ve farmakokinetik analizlerle beraber terapötik ilaç izlemi yapabilmek,
10 Yasaklı maddeler konusunda analiz yöntemlerini ve metod validasyonlarını öğrenmek,
11 Nöropsikiyatrik hastalıklarda kullanılan in vivo ve in vitro metodları öğrenmek,
12 İlaç Ar-Ge ile ilişkili makaleleri ve çalışmaları analiz edebilmek,
13 Bilimsel proje, sunum ve yayın yapabilmek,
14 İlaç Ar-Ge sürecinde yer alan kalite sistemlerin tanımak,
15 Bilimsel çalışmalarda ekip çalışması kültürü edinmek ve insan ilişkilerinde tutarlı olabilmek,
16 Etik değerler çerçevesinde çalışma yürütmek ve etik kurul başvuru süreçlerini yönetmek,
17 Özgün ve disiplinler arası sorunların çözümlenmesini gerektiren ortamlarda liderlik yapabilme
18 İlaç Ar-Ge sürecinde yenilikleri takip edebilmek ve yaşam boyu öğrenme alışkanlığı kazanmak,
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ödevler 4 10 40
Sunum / Seminer hazırlama 3 5 15
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 2 10 20
Ara sınavlar 1 5 5
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 2 3 6
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 2 10 20
Yarıyıl sonu sınavı 1 5 5
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     195
AKTS     8.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler, 3. Baskı (DVD ile birlikte), Editörler: G. Temizkan ve N. Arda, İ.Ü. Biyoteknoloji ve Genetik Mühendisliği Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİYOGEM) Yayın No:3, ISBN: 978-975-420-583-1, Nobel Tıp Kitabevleri, İstanbul, 2008.
Yardımcı Kaynaklar The Protein Protocols Handbook, J. M. Walker Ed, Humana Press, 2002 Protein Purification: Principles and Practice, R. K. Scopes, Springer, 1994

Ders İle İlgili Dosyalar