Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
GEN EKSPRESYONU ANALİZİ-I Üçüncü Düzey VGB 539 1 6.00 6.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri
Eğitimin Dili
Koordinatör DR. ÖĞR. ÜYESİ FADİME DALDABAN
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı
Dersin Veriliş Şekli Teorik açıklama uygulama, soru-cevap, danışma, sunum, laboratuvar uygulamaları
Dersin Amacı Biyoinformatik biliminin içerisinde yer alan istatistik yöntemleri ele alınarak uygulama sürecine ilişkin temel bilgilerin verilmesi
Dersin Tanımı

Dersin İçeriği
1 Allel sayısı, gen çeşitliliği, soydaşım katsayısı gibi toplam istatistikler
2 Allelik, genotipik ve haplotipik frekansının tahmini
3 Hardy-Weinberg eşitliği ve Bağlantı dengesizliği
4 Tasarım Çekirdek kümesi veya haplotip etiketleme işaretçilerinin seçimi
5 Popülasyon farklılaştırma testi; Klasik F İstatistikleri
6 Popülasyon farklılaştırma testi; Klasik F İstatistikleri
7 Vize Sınavı
8 Popülasyona özgü F-İstatistiği
9 Popülasyona özgü F-İstatistiği
10 Filogenetik analizler, Frekans, uzaklık ve ağaç analizi
11 Birliktelik analizi
12 Farklı tasarımlar için ortaklık testi
13 SNP simülasyon ve tanımlama gibi yardımcı program araçları
14 Mantel Olasılık tabloları için test ve tam p değerleri
15 Final Sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Lisans programında edinilen birikime dayalı olarak, Gıda Mühendisliği bilgilerini uzmanlık düzeyinde geliştirmek ve derinleştirmek.
2 Bilimsel araştırma planlama, uygulama ve değerlendirme becerilerine sahip olmak.
3 Değişik disiplinlere ait bilgileri Gıda Mühendisliği alanında edindiği bilgilerle harmanlayabilmek.
4 Proses ve süreç tasarımlarında yeni ve uygulama alanı bulabilecek fikir geliştirme ve uygulayabilme becerisine sahip olmak.
5 Gıda teknolojisinde uygulanan son teknolojiler hakkında kapsamlı bilgiye sahip olmak.
6 Lisans seviyesinde ders verebilme yetisibe sahip olmak.
7 Bilişim teknolojisinden (sunum, yazım, istatistik ve grafik programları) etkin bir şekilde yararlanabilmek.
8 Alanı ile ilgili bir problemin çözümünde sorumluluk alabilecek yetkinliğe sahip olmak.
9 Bilimsel çalışmalarda eksik noktaları belirleyerek, çözüm noktasında izleyeceği yolun tayinini gerçekleştirebilecek altyapıya sahip olmak.
10 Uluslarası literatürü takip edebilecek terminolojiye hakim olmak.
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 14 10 140
Ödevler 0 0 0
Sunum / Seminer hazırlama 0 0 0
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 8 8
Ara sınavlar 1 1 1
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 8 8
Yarıyıl sonu sınavı 1 1 1
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     200
AKTS     8.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 20
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 20
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Biyoinformatik Alanında İstatistik, Ezgi Ayyıldız, Vilda Purutçuoğlu , Nobel Yayın Dağıtım, 2014 Introduction to Bioinformatics A Theoretical And Practical Approach, Krawetz, Stephen A., Womble, David D, 2003
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar