Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
MOLEKÜLER BİYOLOJİDE KULLANILAN ARAŞTIRMA YÖNTEMLERİ I Üçüncü Düzey BİY 533 1 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri YOK
Eğitimin Dili TÜRKÇE
Koordinatör PROF. DR. FATMA ÖZTÜRK KÜP
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı PROF. DR. FATMA ÖZTÜRK KÜP
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı -
Dersin Veriliş Şekli Teorik ve laboratuar çalışması
Dersin Amacı Bu ders ile öğrencilerin moleküler tekniklerin öğrenmesi ve biyolojik problemlerin moleküler teknikler kullanılarak analiz edilmesi amaçlanmaktadır.
Dersin Tanımı Bu ders kapsamında; Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler: Genel Bakış, Fiziksel ve Kimyasal homojenizasyon yöntemleri DNA izolasyonu, Kromozomal DNA izolasyonu, Plazmid DNA izolasyonu, Organel DNA izolasyonu, DNA’ nın analizi, Spektral Yöntemler, Elektroforetik Yöntemler, DNA’ enzimatik kesimi, RNA izolasyonu, Total RNA izolasyonu, mRNA’ nın izolasyonu, RNA’ nın analizi, Spektral Yöntemler, Elektroforetik yöntemler, Bakteri transformasyonu, Kimyasal uygulama ile transformasyon, Elektroporasyon ile transformasyon, Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile DNA’ nın çoğaltılması, PCR çeşitleri, Nükleik asit hibridizasyonuna dayalı yöntemler, Microarray analizleri hakkında bilgiler edinilecektir.

Dersin İçeriği
1 Moleküler biyolojide kullanılan yöntemler: Genel Bakış
2 Fiziksel ve Kimyasal Homojenizasyon yöntemleri
3 Makromoleküleri ayırma ve saflaştırma yöntemleri
4 DNA molekülünün izolasyonu; Kromozomal, plazmid ve organel DNA izolasyonu
5 DNA molekülünün spektral ve elektroforetik analizi
6 RNA molekülünün izolasyonu
7 RNA molekülünün spektral ve elektroforetik analizi
8 Bakteri transformasyonu
9 Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR) ile DNA’ nın çoğaltılması
10 Polimeraz zincir reaksiyonu çeşitleri
11 Nükleik asit hibridizasyonuna dayalı yöntemler
12 DNA dizi analizi
13 DNA microarray Teknikleri
14 Biyoinformatik
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Fiziksel ve Kimyasal homojenizasyon yöntemlerini öğrenir ve uygular.
2 DNA izolasyonunu gerçekleştirir ve DNA’ nın analizini öğrenir.
3 RNA izolasyonu ve RNA’ nın analizi hakkında bilgi sahibi olur.
4 Polimeraz zincir reaksiyonunu (PCR) öğrenir ve uygular.
5 Bakteri transformasyonu hakkında bilgi sahibi olur.
6 Nükleik asit hibridizasyonuna dayalı yöntemler hakkında bilgi sahibi olur.
7 DNA dizi analizi ve DNA microarray tekniklerinin temellerini kavrar.
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Preklinik ilaç Ar-Ge faaliyetlerini, metodlarını öğrenmek ve süreci yönetebilmek,
2 İlaç Ar-Ge faaliyetlerinde yer alan cihazları kullanabilmek,
3 İlaç uygulama ve araştırma tekniklerini kullanarak yeni ilaç araştırma geliştirme çalışmaları yapabilmek,
4 İlaç Ar-Ge faaliyetinden ürüne dönük sonuçlar elde etmek,
5 Beşeri, veteriner, zirai ve çevre sağlığı ilaç sanayisi ihtiyaçlarına yönelik çalışmak,
6 Kimyasal sentez metodlarını öğrenmek ve sentez aracılığıyla ürün geliştirmek,
7 Biyoinformatik temel prensiplerini öğrenmek ve istatistiksel analizleri yapabilmek,
8 Bitkisel ve diğer kaynaklardan ilaç hammaddesi elde etmek ve bunları formülasyona dönüştürmek,
9 Farmakogenetik ve farmakokinetik analizlerle beraber terapötik ilaç izlemi yapabilmek,
10 Yasaklı maddeler konusunda analiz yöntemlerini ve metod validasyonlarını öğrenmek,
11 Nöropsikiyatrik hastalıklarda kullanılan in vivo ve in vitro metodları öğrenmek,
12 İlaç Ar-Ge ile ilişkili makaleleri ve çalışmaları analiz edebilmek,
13 Bilimsel proje, sunum ve yayın yapabilmek,
14 İlaç Ar-Ge sürecinde yer alan kalite sistemlerin tanımak,
15 Bilimsel çalışmalarda ekip çalışması kültürü edinmek ve insan ilişkilerinde tutarlı olabilmek,
16 Etik değerler çerçevesinde çalışma yürütmek ve etik kurul başvuru süreçlerini yönetmek,
17 Özgün ve disiplinler arası sorunların çözümlenmesini gerektiren ortamlarda liderlik yapabilme
18 İlaç Ar-Ge sürecinde yenilikleri takip edebilmek ve yaşam boyu öğrenme alışkanlığı kazanmak,
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 0 0 0
Ödevler 5 10 50
Sunum / Seminer hazırlama 2 10 20
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 20 20
Ara sınavlar 1 2 2
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 5 5 25
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 30 30
Yarıyıl sonu sınavı 1 2 2
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     191
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 70
Kısa sınav 0 0
Ödev 2 30
Yarıyıl içi toplam   100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Temel ve İleri Moleküler Biyoloji Yöntemleri, Genomik ve Proteomik Analizler, Editörler: Prof. Dr. Güler Temizkan, Prof. Dr. Nazlı Arda, Nobel Tıp Kitabevi, 2021
Yardımcı Kaynaklar Yaşam Bilimleri Temel ve İleri Uygulamalar, Editörler: Prof. Dr. Leyla AÇIK, Yiğit Can Ateş Molecular Biology of The Cell, Powerpoint sunumlar

Ders İle İlgili Dosyalar