Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
VETERİNER PARAZİTOLOJİDE BİYOİNFORMATİK	İkinci Düzey	VPZ 549	Seçmeli	1	4.00	4.00	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Yalnızca lisans mezunu öğrenciler kabul edilir.
Eğitimin Dili	Türkçe
Koordinatör	PROF. DR. ALPARSLAN YILDIRIM
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	PROF. DR. ALPARSLAN YILDIRIM
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Dr. Öğr. Üyesi Gamze ÖZKAYA, Öğr. Gör. Dr. Sadullah USLU
Dersin Veriliş Şekli	Dersler teorik olacaktır.
Dersin Amacı	Bu dersin amacı öğrencilere biyolojik veritabanlarının ve bazı biyoinformatik araç ve yaklaşımların DNA-RNA ve protein arasındaki bilgi akışını öğretmektir.
Dersin Tanımı	Bu ders, parazitoloji ile biyoenformatik disiplinlerini birleştirerek veteriner hekimlikte paraziter hastalıkların araştırılmasına modern bir bakış sunar.

Dersin İçeriği

1	Biyoinformatiğe giriş
2	Bilgiye ulaşmak
3	İki DNA/protein dizisinin karşılaştırılması: alignment
4	BLAST
5	BLAST
6	SINAV
7	Çoklu dizi analizi-karşılaştırması
8	Moleküler filogeni ve evrim
9	Moleküler filogeni ve evrim
10	RNA için biyoinformatik yöntemler
11	Mikroarray veri analizi, protein yapısı
12	Genomik ve proteomik
13
14
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Veri tabanlarını ve literatürü etkin şekilde kullanabilir.
2	Genomik, proteomik ve biyoformatik terimlerini açıklayabilir.
3	İki dizinin alignment’ını uygulayabilir ve yorumlayabilir.
4	BLAST aramaları gerçekleştirebilir ve sonuçları değerlendirebilir.
5	MSA ile korunan bölgeleri ve motifleri belirleyebilir.
6	Filogenetik ağaç oluşturup evrimsel ilişkileri yorumlayabilir.
7	mikroarray/ifade verisi ve temel RNA analiz yöntemlerini uygulayabilir.
8	Genomik ve proteomik verileri entegre edip biyolojik çıkarım yapabilir.
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1	mesleki rol ve işlevlerini yerine getirmek için gerekli kuramsal ve uygulama bilgilerine sahiptir.
2	Mesleki etik ilke ve değerlere uygun davranır
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	14	2	28
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	0	0	0
Ödevler	0	0	0
Sunum / Seminer hazırlama	4	16	64
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	4	4
Ara sınavlar	1	1	1
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	1	1	1
Yarıyıl sonu sınavı	1	1	1
Araştırma	0	0	0
Toplam iş yükü			99
AKTS			4.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	100
Kısa sınav	0	0
Ödev	0	0
Yarıyıl içi toplam		100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı
Yardımcı Kaynaklar	http://bioinfbook.org/ Zvelebil M, Baum J (2007) Understanding bioinformatics. Garland Science, New York, NY. ISBN 978-0815340249

Ders İle İlgili Dosyalar