Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
NÜKLEİK ASİTLERİN METİLASYONU Birinci Düzey TIB 516 1 4.00 4.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri DNA yapı ve replikasyonu, RNA yapısı, sentezi, çeşitleri ve işlevleri, protein yapı ve sentezi ile gen ifadelerinin düzenlenmesi konularını kapsayan herhangi bir dersi almış olmak.
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı PROF. DR. NURHAN CÜCER
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı YOK
Dersin Veriliş Şekli Anlatım (Ağırlıklı) ve literatür taraması, ödev, tartışma, kısa sunum şekilleri.
Dersin Amacı Epigenetik mekanizmalar ve özellikle DNA metilasyonu ile ilgili ayrıntılı bilgi verilmesi.
Dersin Tanımı Metilasyonnedir, hangi moleküllerde görülür, geri dönüşlü karakter ve rol oynayan enzimler, hangi türlerde görülür, dokuya özgü olma özelliği, genomda metilasyon ve demetilasyon hangi sonuçlara yol açar? Lyonizasyon, CpG adacıkları, Genomik imprinting ve sonuçları, DNA metilasyonu üzerine araştırmalar ve kullanılan metodların ayrıntıları ve mantığı.

Dersin İçeriği
1 Epigenetik ne demektir, bilinen epigenetik regülasyon yöntemleri.
2 DNA hangi formlarda bulunur, bu formların oluşma koşulları,. Z DNA özellikleri, inaktivasyon, etkileri,.
3 Histon asetilasyonu, etkileri, rol oynayan proteinler, DNA’nın yeniden modellenmesi.
4 Metilasyon ne demektir?, protein, RNA ve DNA metilasyonu, rol oynayan enzimler, prokaryot-ökaryot karşılaştırması, rastriksiyon enzimlerle ilgisi v.d.
5 İnsanda ve memelilerde DNA metilasyon, metilasyon- demetilasyon, hiper-hipo metilasyon, dokuya özgü kalıtım, dokulara göre metilasyon oranı ve tablosu,
6 CpG adacıkları, metil sitozin ve timin benzerliği ve etkileri, metilasyonla ve diğer yöntemlerle regüle edilen genlerin ve promoter bölgelerinin karşılaştırılması..
7 Türe ve dokuya özgü metilasyon tablosundaki değişiklikler nelere yol açabilir?
8 Restrikşın enzimi nedir, nerede üretilir, görevleri, işlevsel özellikleri. Hpa II ve Msp I örnekleri, DNA metilasyonunun tüm genomda incelenmesi için yöntem, mantığı, sağladığı bilgi. (I)
9 DNA metilasyonunun seçilen DNA bölgesinde incelenmesi eski ve yeni yöntemlerin tarifi, mantığı, sağladığı bilgilerin karşılaştırılması.
10 Genomik imprinting, X kromatin, doğal veya doğal olmayan sonradan tek gen metilasyonu-demetilasyonu.
11 Normal tabloya uymayan metilasyon ve demetilasyonun yol açtığı olaylar, hastalıklarla ilişkisi.
12 DNA metilasyonu ve hastalıkların tedavisi. Hemoglobin gen ailesi örneği.
13 Literatür taraması, ilgili bir makale üzerine tartışma..
14 Genel tartışma, yorum ve ilave bilgilerin sunulması.
15 DOLDURULACAK
16 DOLDURULACAK
17 DOLDURULACAK
18 DOLDURULACAK
19 DOLDURULACAK
20 DOLDURULACAK

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Gen aktivitesi-fenotip oluşumu ilişkisinde metilasyonun önemi, tek mekanizma olmayışı, kimi genlerin tek doz aktivitelerine ihtiyaç duyulması.
2 Araştırma amaçlı model sistem kullanılırken DNA metilasyonuna rastlanan ve rastlanmayan türlerin bilinmesi.
3 Metilasyonla ifadesi kontrol edilen genlerin diğerlerinden nasıl ayırdedileceğinin öğrenilmesi.
4 DNA metilasyon mekanizması üzerinden yeni tanı veya tedavi yöntemlerinin kurgulanmasına zemin hazırlama.
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Toprak Bilimi ve Bitki Besleme konularında temel kuramsal bilgileri öğrenebilme
2 Temel Bilim ve Mühendislik bilgilerini kullanma becerisi kazanma
3 Toprak Bilimi ve Bitki Besleme konularında temel kuramsal bilgileri uygulayabilme becerisi kazanma
4 Toprak Bilimi ve Bitki Besleme temelinde toprak, bitki, gübre, su ve çevresel atıkların analiz tekniklerini öğrenebilmek ve bu teknikleri toprak verimliliği ile ilgili sorunların çözümüne yönelik olarak kullanabilme becerisi kazanma
5 Doğal kaynakların izlenmesi ve planlanmasında Uzaktan Algılama ve Coğrafi Bilgi Sistemleri tekniklerini anlama ve kullanma becerisi kazanma
6 Arazi yönetimi ve kullanım planlaması konusunda temel kavramları ve kuramları anlama ve kullanma becerisi kazanma
7 Ülkemizde ve Dünyada Toprak Bilimi ve Bitki Besleme alanındaki sorunları görebilme, analiz etme, çözüm üretme ve çözüm önerilerini yazılı ve sözlü olarak topluma aktarma becerisi kazanma
8 Toprak Bilimi ve Bitki Besleme alanındaki ulusal ve uluslararası yenilikleri takip etmek ve kendisini sürekli yenileme ve geliştirme becerisi kazanma
9 Mesleki uygulamalar sırasında elde ettiği bulguları ülke çıkarları ile tarım ve çevre korumayı gözeterek uygulayabilme becerisi kazanma
10 Toprak Bilimi ve Bitki Besleme alanındaki sorunlara çözüm üretebilmeye yönelik araştırma - geliştirme projelerinde yer alabilecek bilgi ve beceriye sahip olma
11 Toprak, su ve diğer doğal kaynakların tanınması, planlanması, korunması ve sürdürülebilir kullanımı ile iş sağlığı ve güvenliği konularında bilgi sahibi olma
12 Ziraat Mühendisliği Mesleğinin etik değerlerine ve gerekli bilimsel formasyona sahip bireyler olarak takım çalışması içerisinde yer alabilmek ve gerektiğinde sorumluluk üstlenebilme
13 Yazılı ve sözlü iletişimde Türk dilini etkin kullanabilmek; alanıyla ilgili uluslararası literatürü izleyebilme ve iletişim kurabilme açısından yabancı dil ve bilgisayar bilgisine sahip olma
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 1 14
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 14 3 42
Ödevler 0 0 0
Sunum / Seminer hazırlama 1 10 10
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 0 0 0
Ara sınavlar 0 0 0
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 28 28
Yarıyıl sonu sınavı 1 1 1
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     95
AKTS     4.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 0 0
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   0
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı YOK
Yardımcı Kaynaklar YOK

Ders İle İlgili Dosyalar