Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
EPİGENETİK MEKANİZMALAR VE GEN İFADESİNİN DÜZENLENMESİ	İkinci Düzey	GEN 513		1	8.00	8.00	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Yalnızca Yüksek Lisans ve doktora öğrencileri bu kursa kabul edilecektir.
Eğitimin Dili	Türkçe
Koordinatör	DOÇ. DR. ASLIHAN KİRAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	Doç.Dr. Aslıhan Kiraz
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Arş.Gör.
Dersin Veriliş Şekli	Teorik
Dersin Amacı	Bu dersin amacı, gen ifadesinin epigenetik düzeyde düzenlenmesinde rol oynayan temel moleküler mekanizmaları kavratmak, epigenetik düzenlemelerin gelişim, farklılaşma ve hastalık süreçlerindeki önemini açıklamak ve öğrencilerin epigenetik verileri güncel yöntemler ışığında yorumlayabilme becerilerini geliştirmektir.
Dersin Tanımı	Bu ders, epigenetik mekanizmaların moleküler temellerini, DNA metilasyonu, histon modifikasyonları, kromatin yeniden düzenlenmesi ve kodlamayan RNA''lar aracılığıyla gen ifadesinin düzenlenmesini, bu süreçlerin gelişim, fizyoloji ve hastalıklarla ilişkisini güncel yaklaşımlar doğrultusunda incelemeyi kapsar.

Dersin İçeriği

1	Epigenetiğe giriş, temel kavramlar, epigenetik ve genetik arasındaki farklar.
2	Kromatin yapısı, nükleozom organizasyonu ve kromatin dinamiği.
3	DNA metilasyonu, DNA metiltransferazlar (DNMT''''''''ler) ve demetilasyon mekanizmaları.
4	Histon modifikasyonları (asetilasyon, metilasyon, fosforilasyon, ubikitinasyon) ve gen ekspresyonunun düzenlenmesi.
5	Kromatin yeniden modellenmesi (chromatin remodeling) kompleksleri ve epigenetik kontrol mekanizmaları.
6	Kodlamayan RNA''lar (miRNA, lncRNA, siRNA, piRNA) ve gen ifadesinin epigenetik düzenlenmesindeki rolleri.
7	Genomik damgalanma (genomic imprinting), X kromozomu inaktivasyonu ve epigenetik kalıtım mekanizmaları.
8	Epigenetik analiz yöntemleri: Bisülfit dizileme, metilasyon analizleri, ChIP, ChIP-Seq, ATAC-Seq ve diğer güncel teknolojiler.
9	Embriyonik gelişim, kök hücre biyolojisi ve hücresel farklılaşmada epigenetik mekanizmalar.
10	Kanserde epigenetik değişiklikler, epigenetik biyobelirteçler ve hedefe yönelik epigenetik tedaviler.
11	Nörogelişimsel, nörodejeneratif ve diğer genetik hastalıklarda epigenetik mekanizmalar.
12	Çevresel faktörler, beslenme, yaşam tarzı ve yaşlanmanın epigenom üzerindeki etkileri; epigenomik ve çoklu-omik yaklaşımlar.
13	Güncel epigenetik araştırmalarının değerlendirilmesi, bilimsel makale sunumları ve vaka tartışmaları.
14	Final sınavı.
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Epigenetiğin temel kavramlarını ve gen ifadesinin düzenlenmesindeki rolünü açıklar.
2	DNA metilasyonu, histon modifikasyonları ve kromatin yeniden modellenmesi mekanizmalarını karşılaştırır.
3	Kodlamayan RNA''''ların gen düzenlenmesindeki işlevlerini değerlendirir.
4	Epigenetik mekanizmaların gelişimsel süreçler ve genetik hastalıklarla ilişkisini yorumlar.
5	Epigenetik analiz yöntemlerinin temel prensiplerini açıklar ve uygun yöntem seçimi yapar.
6	Epigenetik verileri güncel bilimsel literatür doğrultusunda analiz eder ve yorumlar.
7	Epigenetik temelli tanı ve tedavi yaklaşımlarını eleştirel bir bakış açısıyla değerlendirir.
8	Epigenetik alanındaki güncel araştırmaları takip ederek bilimsel tartışmalara katkı sağlayabilecek bilgi ve beceri kazanır.
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1	Kimyasal problemlere temel kimya bilgi ve becerilerini kullanarak tek başına çözümler üretebilme yeteneği
2	İleri araştırmalarda bilgi ve beceri düzeyi planlama ve yürütebilme yeteneği
3	Ulusal ve uluslararası düzeyde kimya ile ilgili konuları izleyebilir, değerlendirip ve yorumlayabilme yeteneği
4	Alanı ile ilgili yeni düşünce ve yöntemler geliştirerek bilgi toplumu oluşum sürecine katkı yapabilme yeteneği
5	Kimya alanında lisans düzeyinde kazanılan bilgileri genişletmek ve geliştirebilme yeteneği
6	Bilimsel ve analitik düşünme ve sentez yapabilme formasyonu kazandırmak
7	Kimya alanında çeşitli cihazları kullanır ve sonuçlarını yorumlayabilme
8	Uzmanlık alanı ile ilgili deneyleri tasarlar ve uygulayabilme yeteneği
9	Deneysel verilerin değerlendirilmesinde çeşitli istatistik metotları ve paket programları kullanabilme yeteneği
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	20	5	100
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	14	3	42
Ödevler	0	0	0
Sunum / Seminer hazırlama	10	2	20
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	20	20
Ara sınavlar	1	0	0
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	1	20	20
Yarıyıl sonu sınavı	1	0	0
Araştırma	0	0	0
Toplam iş yükü			202
AKTS			8.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	40
Kısa sınav	0	0
Ödev	0	0
Yarıyıl içi toplam		40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	1-N. Başaran,Tıbbi Genetik Ders Kitabı,1999 2-Connor,J.M,Ferguson-Smith,M.A.:Essential Medical Genetics.Blackwell Scientific Publications,Third Ed.,1991
Yardımcı Kaynaklar	3-Emery,A.E.H.,(Ed),Rimoin,D.L.:Principles and Practice of Medical Genetics.Third edition,Volume 1,Churchill Livingsto,London, 4-Thompson&Thompson,Genetics in Medicine,6.th edition,2001

Ders İle İlgili Dosyalar