Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PROTEİN KATLANMASI VE FONKSİYONU Birinci Düzey TBT610 1 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Temel moleküler biyoloji bilgisi
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı Prof. Dr. Semih Yılmaz
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Ar. Gör Ahmet Enes Uray
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze, interaktif
Dersin Amacı Proteinlerin katlanması aşamasındaki olayların fonksiyonaliteleri ile olan bağlantısını kavratmak. Protein katlanması için gerekli iç ve dış faktörlerin etkilerini, hücre için çevrenin önemini kavratmak. Homeostazi ile protein katlanması arasındaki ilişkileri anlamak
Dersin Tanımı Bu ders protein katlanması ve bu işlemler için gerçekleşen olaylar zincirinin hücre ve organizma işleyişi konusundaki öneminin öğrencilere anlatılması amacıyla düzenlenmiştir. Öğrencilerin gen, genetik unsurlar, DNA dan protein işleyişine bilgi akışı, katlanma modelleri, Katlanma dinamikleri, mutasyonlar, protein katlanma problemleri, genetik hastalık kavramı, ile ilgili bilgilendirilmesi sağlanacaktır.

Dersin İçeriği
1 Protein yapısı
2 Protein katlanması
3 Protein katlanma modelleri
4 Protein katlanma dinamikleri
5 Katlanmada gerçekleşen olayların zaman ölçeği; lokal hareketler
6 Katlanmada gerçekleşen olayların zaman ölçeği; rijid hareketler
7 Katlanmada gerçekleşen olayların zaman ölçeği; büyük domainlerin hareketi
8 Ara sınav
9 Protein agregasyonu
10 Katlanmayı etkileyen faktörler
11 Protein katlanması ile ilgili fonksiyonel problemler
12 Hücre içi metabolik hız ve protein katlanması
13 Ekstrem şartlarda protein katlanması
14 Katlanmada intramoleküler kuvvetler
15 Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Protein yapısal organizasyonu ve farklılıklarının anlaşılması
2 Protein katlanma modellerinin anlaşılması
3 Lokal hareket, rijid hareket ve büyük domain hareketleri yönüyle katlanma dinamiklerinin anlaşılması
4 Katlanma problemi ve genetik hastalık bağlantısının anlaşılması
5 Metabolizma hızı ve katlanma bağlantısının anlaşılması
6 Katlanmayı etkileyen hücre içi/dışı faktörlerin anlaşılması
7 İntramoleküler kuvvetlerin anlaşılması
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Etik değerler ve kalite bilinci çerçevesinde ulusal ve uluslararası taleplere cevap verecek nitelikte mühendisler yetiştirmek.
2 Endüstride ve araştırma kuruluşlarında, uygulama ve araştırma alanında kariyer hedeflerine uygun planlama yeteneğine sahip mühendisler yetiştirmek.
3 Küresel boyutta bilimsel ve teknolojik gelişmelere uyum sağlayabilen, etkin iletişim kurma becerisi kazanmış mühendisler yetiştirmektir.
4 - Matematik, fen ve mühendislik bilgilerini uygulama becerisi
5 Deney tasarımlama ve yapma ile deney sonuçlarını analiz etme ve yorumlama becerisi
6 İstenen gereksinimleri karşılayacak biçimde bir sistemi, parçayı ya da süreci tasarlama becerisi
7 Disiplinler arası takımlarda çalışabilme becerisi
8 Mühendislik problemlerini tanımlama, formüle etme ve çözme becerisi
9 Mesleki ve etik sorumluluk bilinci
10 Etkin iletişim kurma becerisi
11 Mühendislik çözümlerinin, evrensel ve toplumsal boyutlarda etkilerini anlamak için gerekli genişlikte eğitim
12 Yaşam boyu öğrenmenin gerekliliği bilinci ve bunu gerçekleştirebilme becerisi
13 Çağın sorunları hakkında bilgi
14 Mühendislik uygulamaları için gerekli olan teknikleri ve modern araçları kullanma becerisi
15 Bilim ve teknolojideki gelişmeleri izleyebilecek temel alt yapıya sahip mühendis
16 Ulusal ve uluslararası taleplere uygun olarak uygulanabilir teknolojiler geliştiren mühendislik yeteneği
17 Mevcut ürün ve teknolojilerin her türlü verimliliğini geliştirici özgün fikirler geliştirme ve uygulama
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 13 3 39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 6 5 30
Ödevler 3 10 30
Sunum / Seminer hazırlama 2 4 8
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 7 7
Ara sınavlar 1 5 5
Proje (Yarıyıl ödevi) 1 15 15
Laboratuvar 3 3 9
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 7 7
Yarıyıl sonu sınavı 1 5 5
Araştırma 2 15 30
Toplam iş yükü     185
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 60
Yarıyıl içi toplam   100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Protein structure-folding-(Methods in Molecular Biology 168) Kenneth P. Murphy (auth.), Kenneth P. Murphy (eds.) - Protein Structure, Stability, and Folding-Humana Press (2001)
Yardımcı Kaynaklar Lehninger - Principles of Biochemistry 5th Ed by David L. Nelson and Michael M. Cox

Ders İle İlgili Dosyalar