Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
YENİ NESİL DİZİLEME TEKNOLOJİLERİ	İkinci Düzey	MBG518		1	6.00	6.00	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri
Eğitimin Dili	Türkçe
Koordinatör	DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜGE GÜLCİHAN ÖNAL
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	DR. ÖĞR. ÜYESİ MÜGE GÜLCİHAN ÖNAL
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı
Dersin Veriliş Şekli	Yüz yüze
Dersin Amacı	Bu dersin amacı, yeni nesil dizileme teknolojilerinin temel prensipleri, çalışma süreçleri, veri analizi yaklaşımları ve moleküler biyoloji ile genetik alanındaki uygulamaları hakkında öğrencilere bilgi kazandırmaktır.
Dersin Tanımı	Yeni nesil dizileme teknolojilerinin gelişimi, dizileme platformları, örnek hazırlama ve kütüphane oluşturma yöntemleri, hedefe yönelik dizileme, tüm ekzom ve tüm genom dizileme yaklaşımları, RNA dizileme uygulamaları, veri kalite kontrolü, temel biyoenformatik analizler, varyant değerlendirme ve yeni nesil dizilemenin araştırma ve klinik uygulamaları ele alınmaktadır.

Dersin İçeriği

1	Yeni nesil dizilemeye (NGS) giriş, tarihsel gelişim ve temel kavramlar
2	NGS platformlarının karşılaştırılması: Illumina, Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore
3	NGS deney tasarımı ve çalışma akışı
4	Nükleik asit izolasyonu, kalite kontrol ve örnek hazırlama
5	Kütüphane hazırlama yöntemleri ve barkodlama stratejileri
6	Hedefe yönelik panel, ekzom ve tüm genom dizileme yaklaşımları
7	RNA-seq ve transkriptomik uygulamalar
8	Ödev / öğrenci sunumları
9	Ham veri formatları ve kalite değerlendirme (FASTQ, Phred skorları)
10	Temel biyoenformatik analizler: hizalama ve varyant çağırma
11	Varyant anotasyonu ve klinik veri tabanları
12	Tek hücre dizileme ve mekânsal transkriptomik
13	Metagenomik ve mikrobiyom uygulamaları
14	Etik, veri yönetimi, gelecekteki teknolojiler ve genel değerlendirme
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Yeni nesil dizileme teknolojilerinin temel prensiplerini ve tarihsel gelişimini açıklar.
2	Farklı dizileme platformlarının (Illumina, Ion Torrent, PacBio, Oxford Nanopore vb.) çalışma prensiplerini karşılaştırır.
3	Yeni nesil dizileme verilerinin analizinde kullanılan temel biyoenformatik yaklaşımları açıklar.
4	Yeni nesil dizileme çalışmalarına ait bilimsel literatürü yorumlayarak elde edilen bulguları tartışır.
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1	Hemşirelik felsefesini bilir
2	Hemşireliğin temel kavramları arasındaki ilişkiyi analiz eder
3	Hemşireliğin mesleki değerlerini içselleştirir
4	Hemşirelik alanında derin ve sistematik bir bilgi düzeyine sahip olur
5	Sağlık alanındaki modern, teknik ve bilgi teknolojilerini bilerek kanıta dayalı hemşirelik uygulamaları doğrultusunda bilgi ve becerisini kullanır
6	Grup içinde -lider ve/veya üye olarak- uyum içinde çalışır.
7	İş yaşamında yeni durumları çabuk öğrenir ve farklı beceriler geliştirir.
8	Geliştirdiği profesyonel hemşirelik bilincini hemşirelik bakımına yansıtır
9	Hemşirelik alanına katkı sağlayacak araştırmalar yapar
10	Hemşirelik alanına özgü bilimsel gelişmeleri izler
11	Hemşirelik alanına özgü eriştiği bilgiyi analiz eder
12	Kanıta dayalı uygulamaları hemşirelik bakımına yansıtır
13	Hemşirelik öğretiminin temel felsefesini bilir
14	Hemşirelik öğretiminde uygun öğretim ilke ve yöntemleri kullanır
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	0	0	0
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	0	0	0
Ödevler	0	0	0
Sunum / Seminer hazırlama	0	0	0
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	0	0	0
Ara sınavlar	0	0	0
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavı	0	0	0
Araştırma	0	0	0
Toplam iş yükü			0
AKTS			0.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	0	0
Kısa sınav	0	0
Ödev	0	0
Yarıyıl içi toplam		0
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		0
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		0
Genel toplam		0

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar