Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
FONKSİYONEL GENOMİK Üçüncü Düzey TBT 508 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı Doç.Dr. Melike BAKIR
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu ders ile, fonksiyonel genom bilimi ve çalışmaları hakkında bilgilendirmek amaçlanmaktadır. DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri), Moleküler haritalama tekniği ve örnekleri, Fiziksel haritalama yöntemleri, SNP varyasyonu ve genotipleme, Gen expresiyon analizleri; Mikroarray uygulamaları, Mikroarray data verilerinin analizi, RNA-seq uygulamları ve analiz yöntemleri dersin içeriğini oluşturmaktadır.
Dersin Tanımı Bu ders ile, fonksiyonel genom bilimi ve çalışmaları hakkında bilgilendirmek amaçlanmaktadır. DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri), Moleküler haritalama tekniği ve örnekleri, Fiziksel haritalama yöntemleri, SNP varyasyonu ve genotipleme, Gen expresiyon analizleri; Mikroarray uygulamaları, Mikroarray data verilerinin analizi, RNA-seq uygulamları ve analiz yöntemleri dersin içeriğini oluşturmaktadır.

Dersin İçeriği
1 Fonksiyonel genom bilimine giriş
2 DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri
3 DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri
4 Moleküler haritalama tekniği ve örnekleri
5 Fiziksel haritalama yöntemleri
6 SNP varyasyonu ve genotipleme
7 SNP varyasyonu ve genotipleme
8 ARA SINAV
9 Gen expresiyonu teknikleri: Real Time qPCR ve analizi
10 Gen expresiyonu teknikleri: Mikroarray uygulamaları
11 Gen expresiyonu teknikleri: Mikroarray data verilerinin analizi
12 Gen expresiyonu teknikleri: RNA-seq uygulamları
13 Gen expresiyonu teknikleri: RNA-seq analiz yöntemleri
14 Güncel çalışmalardan örnekler
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Bitkilerde, genom, ileri ve ters genetik konularındaki temel ve ileri teknik uygulamaları, bitkilerde büyüme, gelişme, stres dayanıklılık gibi temel fizyolojik konuların hücresel mekanizmalar ile aydınlatılmasına hakkında bilgi sahibi olacaktır.
2
3
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Kore Dili ve Edebiyatı çalışma alanındaki güncel ve ileri düzeydeki bilgileri özgün düşünce ve araştırma ile uzmanlık düzeyinde geliştirir, derinleştirir. Bununla ilgili çalışmalar yürütür ve alanına yenilik getirecek özgün tanım ve kavramlar oluşturur.
2 Disiplinler arası çalışma yapar, alanıyla ilgili gelişmeleri ve tartışmaları takip eder, bilgileri sistematik olarak değerlendirir. Uzmanlık gerektiren bilgileri kullanarak özgün sonuçlara ulaşır.
3 Kore Dili ile ilgili bilgi ve becerilerini geliştirebilmek için yerli ve yabancı kaynakları tanır ve kullanır
4 Alanındaki bilgileri farklı disiplinlerden edindiği bilgilerle birleştirerek çözümler ve yorumlar; bilgi birikimi ile kendi alanında ve farklı alanlardaki uzman kişilerle tartışır.
5 Özgün bir konuyu araştırır, kavrar ve edindiği verileri yorumlayarak bilginin sınırlarını genişletir.
6 Kore Dili alanında edindiği bilgileri kullanarak projeler yürütür ve alanına yenilik getirecek uluslararası ve ulusal yayınlar yaparak bilimsel çalışmalara katkıda bulunur.
7 Tarihi ve kültürel mirasın ve çevrenin korunmasına yönelik olarak ilgili alanda çalışma yetkinliğine sahip olur.
8 Kore Dili alanında edindiği uzmanlık düzeyindeki kuramsal ve uygulamalı bilgileri kullanarak alanı ile ilgili yeni düşüncelerin analizini, sentezini ve eleştirel değerlendirmesini yapar, yeni öneriler getirir.
9 Özgün bir çalışmayı, programı veya projeyi zamanında ve istenilen nitelikte gerçekleştirir, ekip çalışmalarında sorumluluk alarak çözüm üretir, akademik ve mesleki kurum ve kuruluşların faaliyetlerine katkıda bulunur.
10 Kore Dili alanıyla ilgili verileri toplar, yorumlar, belgeler ve kullanır. Tarihi-kültürel çevrenin korunması için gerçekleştirilenleri bilimsel, kültürel, sanatsal, toplumsal ve etik değerleri gözeterek denetler ve bu değerleri anlatır.
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 0 0 0
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 0 0 0
Ödevler 0 0 0
Sunum / Seminer hazırlama 0 0 0
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 0 0 0
Ara sınavlar 0 0 0
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavı 0 0 0
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     0
AKTS     0.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   60
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   0
Genel toplam   60

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Functional Plant Genomics (Editors:J.-F. Morot-Gaudry, P.Lea, J.-F.Briat)
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar