Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
FONKSİYONEL GENOMİK İkinci Düzey TBT 508 Seçmeli 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı Doç.Dr. Melike BAKIR
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu ders ile, fonksiyonel genom bilimi ve çalışmaları hakkında bilgilendirmek amaçlanmaktadır. DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri), Moleküler haritalama tekniği ve örnekleri, Fiziksel haritalama yöntemleri, SNP varyasyonu ve genotipleme, Gen expresiyon analizleri; Mikroarray uygulamaları, Mikroarray data verilerinin analizi, RNA-seq uygulamları ve analiz yöntemleri dersin içeriğini oluşturmaktadır.
Dersin Tanımı Bu ders ile, fonksiyonel genom bilimi ve çalışmaları hakkında bilgilendirmek amaçlanmaktadır. DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri), Moleküler haritalama tekniği ve örnekleri, Fiziksel haritalama yöntemleri, SNP varyasyonu ve genotipleme, Gen expresiyon analizleri; Mikroarray uygulamaları, Mikroarray data verilerinin analizi, RNA-seq uygulamları ve analiz yöntemleri dersin içeriğini oluşturmaktadır.

Dersin İçeriği
1 Fonksiyonel genom bilimine giriş
2 DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri
3 DNA sekanslama teknikleri (klasik ve yeni nesil sekanslama sistemleri
4 Moleküler haritalama tekniği ve örnekleri
5 Fiziksel haritalama yöntemleri
6 SNP varyasyonu ve genotipleme
7 SNP varyasyonu ve genotipleme
8 ARA SINAV
9 Gen expresiyonu teknikleri: Real Time qPCR ve analizi
10 Gen expresiyonu teknikleri: Mikroarray uygulamaları
11 Gen expresiyonu teknikleri: Mikroarray data verilerinin analizi
12 Gen expresiyonu teknikleri: RNA-seq uygulamları
13 Gen expresiyonu teknikleri: RNA-seq analiz yöntemleri
14 Güncel çalışmalardan örnekler
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Bitkilerde, genom, ileri ve ters genetik konularındaki temel ve ileri teknik uygulamaları, bitkilerde büyüme, gelişme, stres dayanıklılık gibi temel fizyolojik konuların hücresel mekanizmalar ile aydınlatılmasına hakkında bilgi sahibi olacaktır.
2
3
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Tarımsal Biyoteknolojinin yüksek lisansını yaptığı alanında temel yöntem ve tekniklere yönelik yeterli uzmanlığa sahip olur
2 Biyoteknolojinin; Bitki Biyoteknolojisi, Hayvan Biyoteknolojisi, Mikrobiyal Biyoteknoloji, alanlarında akademik ve endüstriyel boyutta, uluslar arası düzeyde yeterliliğe sahiptir
3 Tarımsal Biyoteknoloji alanındaki yeni konulara açıktır, tarımda faliyetlerin yürütülmesi ve verimliliğin arttırılmasında stratejik çözümler üretebilir, girişimci ve geliştirici niteliklere sahiptir,
4 Kamu ve özel sektörde, Biyoteknoloji ile ilişkili tarımsal alanlarda üretim, araştırma ve geliştirme; ulusal-uluslar arası düzeyde proje oluşturma, yönetme yeterliliğine sahiptir,
5 Biyoteknoloji alanındaki çalışmaların gerektirdiği düzeyde bilişim ve iletişim teknolojilerine yönelik yeterliliğe sahiptir
6 Biyoteknoloji alanındaki çalışmalarda etik kuralların bilincinde, çevre ve canlı yaşam dengelerinin korunmasında dikkatlidir
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 0 0 0
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 0 0 0
Ödevler 0 0 0
Sunum / Seminer hazırlama 0 0 0
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 0 0 0
Ara sınavlar 0 0 0
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavı 0 0 0
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     0
AKTS     0.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   60
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   0
Genel toplam   60

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Functional Plant Genomics (Editors:J.-F. Morot-Gaudry, P.Lea, J.-F.Briat)
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar