Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
BİYOİNFORMATİK VE DOKU MÜHENDİSLİĞİ Birinci Düzey SCR 514 1 8.00 8.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı YRD.DOÇ. DR. YAGUT AKBAROVA
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Bu dersin amacı, bir dizi ders ve laboratuvar uygulamaları yoluyla Bioinformatik ile ilgili temel kavramları öğrencilere öğretmek ve bilgi sahibi yapmaktır
Dersin Tanımı Bu ders, biyoinformatik araştırmalarda kullanılan en önemli ve temel kavramları, yöntemleri ve araçları tanıtmak için tasarlanmıştır. Konular biyoinformatik veritabanlarını, dizi ve yapı hizalama, protein yapı tahmini, protein katlanması, protein-protein etkileşimlerini içerir.

Dersin İçeriği
1 Biyoinformatiğe giriş
2 Biyolojik veritabanları
3 Özel veritabanları
4 Sekans analizleri
5 Lokal hizalama, BLAST
6 Global hizalama, Clustal
7 Filogenetik ağaçlar
8 Gen bulma ve sekans annotasiyonu
9 SNP annotasyonu ve değerlendirilmesi
10 Promotör elemanlarının bulunması ve analizi
11 Protein veritabanları
12 Protein yapılarının 3D görüntüleme araçları
13 İlaç veritabanları
14 İlaçların hedef genleri, transporterleri ve metabolize eden enzimler
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Biyolojik veri tabanları
2 Veri tabanlarındaki bilgilerin annotasyonu
3 Genler ve hastalıklar hakkında bilgi edinme
4 DNA ve Protein dizilerinin analizi
5 Genler ve ilaçlar hakkında bilgi edinme
6 Genler ve yolaklar hakkında bilgi edinme
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Turizm sektörünün yapısı, işleyişi ve ülke kalkınmasındaki önemi konusunda bilgi sahibi olur,
2 İngilizcede Avrupa Dil Portföyü C2 genel düzeyinde okuma, anlama, konuşma ve yazma becerileri gösterir,
3 İkinci bir yabancı dilde en az Avrupa Dil Portföyü B2 genel düzeyinde okuma, anlama, konuşma ve yazma becerileri gösterir,
4 Yazılı, sözlü ve sözsüz olarak etkili iletişim kurar ve sunum becerileri gösterir.
5 Grup yönetimi ilkelerini bilir ve uygular.
6 Toplumsal ve mesleki etik değerleri bilir, bunları eleştirel bir bakış açısıyla değerlendirir ve uygun davranışları geliştirir.
7 Hem temel hem de alanıyla ilgili bilgi ve iletişim teknolojilerini ve yazılımlarını ileri düzeyde kullanır.
8 İşletme, iktisat ve sosyal psikoloji alanındaki temel kavramlar, kuramlar, ilkeler ve olgular hakkında bilgi sahibi olur.
9 Turist rehberliği mesleği ile ilgili hizmet verme süreçlerini bilir ve ziyaretçi memnuniyeti sağlayacak şekilde yerine getirir.
10 Bir seyahat işletmesini etkin bir şekilde yönetebilmek için güncel yönetim teorilerini ve uygulamalarını bilir ve uygular.
11 Türkiye’de yaşamış olan uygarlıkların kültür, tarih, din ve sanatları hakkında detaylı bilgiye sahip olur, analiz eder ve yorumlar.
12 Dünya ve Türkiye coğrafyası hakkında detaylı bilgiye sahip olur.
13 Bir turu planlar, uygular ve denetler.
14 İlkyardım konusunda temel bilgiye sahip olur ve uygular.
15 Turizm alanı ve turist rehberliği ile ilgili hukuki düzenlemeleri ve mesleki standartları bilir ve uygular.
16 Bilgi ve verileri mesleki anlamda tanımlar, analiz eder, sentezler, yorumlar ve değerlendirir.
17 Başkalarıyla ve bağımsız olarak etkin bir şekilde çalışır.
18 Kendini kişisel ve mesleki anlamda sürekli geliştirir, kendi kendine öğrenme için sorumluluk alır ve bunu gösterir.
19 Farklı kültürleri tanır, anlar ve farklı kültürlerle iletişim kurar.
20 Kişisel bakıma, hijyene, giyime ve görünüme turist rehberliğinin gerektirdiği şekilde özen gösterir.
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 30 2 60
Ödevler 20 2 40
Sunum / Seminer hazırlama 1 2 2
Kısa sınavlar 3 1 3
Ara sınavlara hazırlık 2 2 4
Ara sınavlar 1 3 3
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 14 2 28
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 3 2 6
Yarıyıl sonu sınavı 1 3 3
Araştırma 3 1 3
Toplam iş yükü     194
AKTS     8.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 50
Kısa sınav 0 0
Ödev 3 50
Yarıyıl içi toplam   100
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   50
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   50
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Bioinformatics For Dummies, 2nd Edition Jean-Michel Claverie, Cedric Notredame ISBN: 978-0-470-08985-9
Yardımcı Kaynaklar Bioinformatics for Geneticists, Michael Barnes, Ian C Gray ISBN: 0-470-84394-2

Ders İle İlgili Dosyalar