Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
PCR TEMELLİ GENETİK ANALİZ YÖNTEMLERİ Birinci Düzey TBT 545 1 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz-yüze
Dersin Amacı PCR Temelli Genetik Analiz Yöntemleri dersi kapsamında öğrencilerin PCR tekniğinin temelleri, genel PCR reaksiyonlarının tasarımını öğrenmesi amaçlanmıştır. Bu sayede dersi alan öğrencilerin derste edindikleri bilgi ve tecrübeleri kendi çalışmalarına uyarlayabilmesi hedeflenmektedir.
Dersin Tanımı PCR Temelli Genetik Analiz Yöntemleri dersi kapsamında PCR tekniğinin temelleri, genel PCR reaksiyonlarının tasarımı, PCR çeşitleri ve PCR tabanlı teknikler, öncü nükleotid dizilerinin (primer) dizayn edilmesi, mutasyon analiz yöntemleri, Primer Uzama Reaksiyonu, DNA Dizi Analizi; filogenetik ve kimliklendirme çalışmaları için fragment analizleri ile gen kopya sayısının ve gen ifadesinin saptanması amacıyla kullanılan eş zamanlı (Real-Time) PCR tekniklerinin temelleri ve tasarımı anlatılacaktır. Ayrıca PCR tekniklerinin güncel çalışmalarda nasıl uygulandığını görmek amacıyla makale tartışmaları da yapılmaktadır.

Dersin İçeriği
1 PCR tekniğine giriş ve PCR tekniğinin temelleri
2 Uygun deney tasarımının oluşturulması
3 Genel PCR reaksiyonlarının tasarımı
4 PCR çeşitleri ve PCR tabanlı teknikler
5 PCR çeşitleri ve PCR tabanlı teknikler
6 PCR optimizasyonu
7 Öncü nükleotid dizilerinin (primer) dizayn edilmesi
8 Ara sınav
9 Mutasyon analiz yöntemleri
10 Primer Uzama Reaksiyonu
11 DNA Dizi Analiz yöntemleri
12 Biyoinformatik araçlarla dizilerin kıyas ve hizalanmaları
13 Filogenetik analiz yöntemleri
14 Eş zamanlı (Real-Time) PCR tekniklerinin temelleri
15 Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 PCR tekniğinin temelleri bilir
2 Genel PCR reaksiyonlarının tasarımını yapabilir
3 PCR tekniklerinin güncel çalışmalarda nasıl uygulandığını bilir.
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Heykel sanatını çağın dinamikleriyle beraber düşünür, yaratıcı ve özgün eserler ortaya koyar.
2 Heykel sanatında geleneksel malzeme/teknikleri tanır ve uygulamalı olarak bilir.
3 Sanat ve heykel sanatıyla ilgili ulusal ve uluslararası gelişmeleri takip eder.
4 Heykel eğitimindeki yöntem ve yaklaşımların gelişimini ve dönüşümünü, diğer disiplinler ile ilişki kurarak değerlendirir.
5 Edindiği sanat kültürü ve eğitimi ile ortaya koyduğu özgün eserlerle, toplumun sanat düşüncesine katkıda bulunur.
6 Alanı ile ilgili terminolojiyi bilir. Buna uygun olarak sanatsal ifade biçimlerini doğru ve etkili olarak kullanır.
7 Alanıyla ilgili teknolojik gelişmeleri takip eder ve bunları uygulama sürecinde etkili olarak kullanır.
8 Bir sanat projesini geliştirme, planlama ve uygulama becerisine sahip olur.
9 Diğer meslek alanlarında ve sosyal konularda oluşturulan ekip çalışmalarında etkin olarak yer alır ve sorumluluk üstlenir.
10 Demokrasiye ve insan haklarına, toplumsal, bilimsel, kültürel değerlere ve mesleki etik ilkelere uygun davranır.
11 Mesleki bilgi ve becerilerini sürekli olarak geliştirir.
12 Diğer sanat disiplinleri ile ilgili uygulamaları da asgari düzeyde kullanır.
13 Temel sanat prensiplerini tanır ve kompozisyon içerisinde kullanarak analitik düşünce becerisi kazanır.
14 Etkin bir şekilde görsel, yazılı ve sözlü iletişim kurar.
15 Mesleki uygulamalarda etik sorumlulukları kavrar, benimser ve uygular.
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 3 14 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 3 14 42
Ödevler 2 14 28
Sunum / Seminer hazırlama 2 14 28
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 14 14
Ara sınavlar 1 1 1
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 2 14 28
Yarıyıl sonu sınavı 1 1 1
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     184
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 40
Kısa sınav 0 0
Ödev 0 0
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Sambrook, J., & Russell, D. W. (2001). Molecular Cloning: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press. McPherson, M. J., & Møller, S. G. (2006). PCR. Taylor & Francis Group.
Yardımcı Kaynaklar Dieffenbach, C. W., & Dveksler, G. S. (2003). PCR Primer: A Laboratory Manual. Cold Spring Harbor Laboratory Press.

Ders İle İlgili Dosyalar