Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
OMİK TEKNOLOJİLERİNE GİRİŞ İkinci Düzey BİF512 1 6.00 6.00 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili Türkçe
Koordinatör PROF. DR. HALİT CANATAN
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı YRD.DOÇ. DR. ÖZKAN UFUK NALBANTOĞLU
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı yok
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze
Dersin Amacı Farklı disiplinlerden gelen öğrencilere omik teknolojileri hakkında bilgi vermek, tıp ve biyolojide bilgi kavramı, bilgi teorisi, algı sisteminde bilginin kodlanması ve aktarımı, fenomik, genomik, proteomik, epigenomik ve metabolomik bilgisi ile son yıllarda biyoinformatik araştırmalarda sıklıkla kullanılan farmakogenetik yöntemleri anlatmak ve bu yaklaşımların biyoinformatik araştırmalardaki yerini öğretmek.
Dersin Tanımı Bu derste biyoinformatik biliminin ana analiz verilerinden olan omik verisi ve bunları oluşturan alt bilimdalları genomik, transkriptomik, proteomik ve metabolomik bilimleri hakkında başlangıç bilgileri işlenmektedir.

Dersin İçeriği
1 Disiplinlerarası bir bilim dalı: Biyoinformatik
2 Biyoinformatikte Temel Kavramlar, Genel Hücre ve Biyomolekül Bilgisi
3 Fenomik
4 Genomik ve Teknolojileri
5 Genomik analiz
6 Transkriptomik ve Teknolojileri
7 Transkriptomik analiz
8 Proteomik ve Teknolojileri
9 Proteomik analiz
10 Mirnomik
11 Metabolomik ve teknolojileri
12 Epigenomik
13 Metagenomik
14 Sistem biyolojisine giriş
15
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Omik teknolojileri ve büyük veri üretimi hakkında bilgi sahibi olma
2 Omik teknolojilerinden üretilen veriyi işleme teknikleri hakkında bilgi sahibi olma
3 Omik veri bütünleştirme ve hücre süreçleri hakkında sayısal verinin kullanılma tekniklerini kavrama
4 Omik veri ışığında sistem biyolojisi kavramının anlaşılması.
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Beslenme ve Diyetetik alanıyla ilgili kanıta dayalı güncel bilgiler ve teknolojik araç gereçler konusunda bilgi sahibi olma.
2 Uzmanlık düzeyinde bireysel veya disiplinler arası yaptığı bilimsel çalışmaların verilerini yorumlama, analiz etme ve raporlama bilgisine sahip olma.
3 Beslenme ve Diyetetik alanıyla ilgili edindiği bilgileri kullanarak yeni bilgiler oluşturmak için gereken teknolojik donanımları kullanarak bilimsel araştırmalar yapabilme.
4 Bilimsel araştırmaların analizi için doğru istatistiksel yöntemleri kullanabilme.
5 Beslenme ve Diyetetik alanıyla ilgili çalışmaları bağımsız ya da ekip olarak gerçekleştirerek bilimsel makaleleri ulusal düzeyde yayınlayabilme ve / veya sunabilme.
6 Yaşam boyu öğrenme ilkelerini benimseyerek kendini güncelleyebilme.
7 Beslenme ve Diyetetik alanında veya dışındaki birey ya da gruplarla sözlü veya yazılı iletişime geçerek kalite süreçlerine uyarak, güncel bilimsel gelişmeleri tartışabilme, paylaşabilme.
8 Etik ilkeler doğrultusunda bilimsel bilgileri toplar, yorumlar, birey ve toplumu gözeterek, ulusal ve uluslararası beslenme plan ve politikalarına yön verecek çalışmalara katkıda bulunabilme, yürütebilme, yönetebilme, değerlendirebilme.
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 0 0 0
Ödevler 14 2 28
Sunum / Seminer hazırlama 7 1 7
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 0 0 0
Ara sınavlar 1 2 2
Proje (Yarıyıl ödevi) 0 0 0
Laboratuvar 0 0 0
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavı 1 2 2
Araştırma 0 0 0
Toplam iş yükü     81
AKTS     3.00

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 10
Kısa sınav 0 0
Ödev 7 70
Yarıyıl içi toplam   80
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   80
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   20
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar