Dersin Adı Dersin Seviyesi Dersin Kodu Dersin Tipi Dersin Dönemi Yerel Kredi AKTS Kredisi Ders Bilgileri
BIOCHEMISTRY OF GENE EXPRESSION İkinci Düzey AGS 542 2 7.50 7.50 Yazdır
   
Dersin Tanımı
Ön Koşul Dersleri Yok
Eğitimin Dili İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı Prof. Dr. Semih YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı Ahmet Enes URAY
Dersin Veriliş Şekli Yüz yüze, interaktif
Dersin Amacı Bu dersin sonunda öğrenciler, belirtilen alanlarla ilgili ileri düzeyde bilgi ve birikimini gösterebilecek; genomdan proteine, enzim kinetiği davranış ve mekanizmaları, DNA transkripsiyonunun mekanizması ve kontrolü, DNA hasar onarımı ve bütünlüğü, protein sentezi ve translasyonel kontrol, organizmalarda gen ekspresyonunun kontrolü Sinyal iletimi.
Dersin Tanımı Bu dersin amacı gen ifadesinin biyokimyası ile ilgili temel prensip ve konuların ileri düzeyde anlaşılması ve deneysel temellerin kazandırılmasıdır. Öğrenciler, konularla ilgili ileri düzeyde bilgi ve beceriye sahip olmaya yönlendirilecek.

Dersin İçeriği
1 Genin yapısı
2 Prokaryotlarda transkripsion
3 Prokaryotlarda gen ifadesinin incelenmesi
4 Transkripsiyonel düzenleme ve transkripsiyon sonrası işleme
5 Gen ifadesinin post transkripsiyonel düzenlemesi
6 Bir genin özellikleri ve gen ifadesinin kontrolü
7 Transkripsiyon faktörleri ve RNA polimeraz kompleksi
8 Ara sınav
9 Cis düzenleyici unsurlar
10 Epigenetik düzenlenme
11 Transcript algılama - bireysel ve sistem yaklaşımları
12 Transkripsiyon faktörü düzenlemesi
13 Transkripsiyon faktörleri ve RNA dinamiği
14 Değişen koşullara bağlı gen ifadesinin rolünü vurgulayan güncel literatür çalışması
15 Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları
1 Protein yapısını anlamak: genomdan proteoma
2 Prokaryotlarda ve ökaryotlarda DNA transkripsiyon mekanizmasını ve kontrolünü anlamak
3 DNA hasarını, onarımını ve bütünlüğünü bilir
4 Protein sentezini ve translasyonel kontrolünü anlamak
5 Prokaryotlarda ve ökaryotlarda gen ekspresyonunun kontrolünü anlar
6 Gen ekspresyonunda sinyal iletiminin rolünü anlar
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi
1 Araştırma yöntem - tekniklerini bilmek ve alanında uygulayabilmek
2 Alanında proje geliştirmek, projesini uygulayarak hayata geçirebilmek
3 Alan içi ve çok alanlı takımlarda etkin çalışmak ve/veya liderlik rolü üstlenebilmek
4 Güncel yayınları, oluşum ve aktiviteleri takip etmek, katılımcı olabilmek
5 Evrensel, ulusal, yerel sanat ve tasarım değerlerinin farkında olabilmek
6 Herhangi bir sanat eserini çözümleyici ve eleştirel bakış açısı ile değerlendirebilmek
7 Estetik beğeni yetkinliğine sahip olmak ve bu yönünü sanat görüşlerine, tasarımlarına yansıtabilmek
8 Çağdaş sanat tasarım materyal ile tekniklerini kullanmak ve estetik bir ürün yaratabilmek
9 Etik kurallara uymak ve sosyal sorumluluk bilinci taşıyabilmek
10 Alanında paylaşıma açık sanatsal etkinlikler düzenlemek; Yaptığı çalışmaları diğerlerine etkili bir şekilde sunabilmek
11 Alanında kullanılan yeni yöntem -teknikleri bilmek ve özgün tasarımlarına ulaşmada kullanabilmek
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü
  Sayısı Süresi (saat) Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim 14 3 42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme) 14 2 28
Ödevler 4 12 48
Sunum / Seminer hazırlama 1 1 1
Kısa sınavlar 0 0 0
Ara sınavlara hazırlık 1 10 10
Ara sınavlar 1 5 5
Proje (Yarıyıl ödevi) 2 10 20
Laboratuvar 3 3 9
Arazi çalışması 0 0 0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık 1 10 10
Yarıyıl sonu sınavı 1 5 5
Araştırma 1 10 10
Toplam iş yükü     188
AKTS     7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
Yarıyıl içi değerlendirme Sayısı Katkı Yüzdesi
Ara sınav 1 30
Kısa sınav 0 0
Ödev 1 10
Yarıyıl içi toplam   40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı   40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı   60
Genel toplam   100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri
Ders kitabı Lehninger - Principles of Biochemistry 5th Ed by David L. Nelson and Michael M. Cox
Yardımcı Kaynaklar Molecular Genetics of Bacteria, 2004, p.360

Ders İle İlgili Dosyalar