| Dersin adı |
Dersin seviyesi |
Dersin kodu |
Dersin tipi |
Dersin dönemi |
Yerel kredi |
AKTS kredisi |
Ders bilgileri |
| ANALYSIS OF GENE EXPRESSION |
İkinci düzey |
AGS 564 |
Seçmeli |
2 |
7.50 |
7.50 |
Yazdır |
|
Ön koşul dersleri
|
Yok
|
|
Eğitimin dili
|
İngilizce
|
|
Koordinatör
|
DOÇ. DR. ÖZHAN ŞİMŞEK
|
|
Dersi veren öğretim eleman(lar)ı
|
DOÇ. DR. ÖZHAN ŞİMŞEK
|
|
Yardımcı öğretim eleman(lar)ı
|
Yok
|
|
Dersin veriliş şekli
|
Face-to-face
|
|
Dersin amacı
|
Bu dersin amacı, ökaryotik genomun yapısı, gen ifadesi ve moleküler kontrol mekanizmalarının irdelenmesidir.
|
|
Dersin tanımı
|
Bu dersin amacı, ökaryotik genomun yapısı, gen ifadesi ve moleküler kontrol mekanizmalarının irdelenmesidir.
|
|
1- |
Overview of Gene Expression
|
|
2- |
Basics of Molecular Biology
|
|
3- |
RNA Extraction and Quantification
|
|
4- |
Reverse Transcription and cDNA Synthesis
|
|
5- |
Polymerase Chain Reaction (PCR)
|
|
6- |
Quantitative Real-Time PCR (qPCR)
|
|
7- |
RNA Sequencing (RNA-Seq) Technologies
|
|
8- |
Data Analysis for RNA-Seq
|
|
9- |
Microarray Technology
|
|
10- |
Differential Gene Expression Analysis
|
|
11- |
Gene Expression Profiling in Diseases
|
|
12- |
Post-Transcriptional Regulation
|
|
13- |
Epigenetic Regulation of Gene Expression
|
|
14- |
Emerging Techniques in Gene Expression Analysis
|
|
15- |
|
|
16- |
|
|
17- |
|
|
18- |
|
|
19- |
|
|
20- |
|
|
1- |
Understand fundamental concepts of gene expression and its regulation.
|
|
2- |
Perform RNA extraction, quantification, and cDNA synthesis.
|
|
3- |
Apply PCR and qPCR techniques for gene expression analysis.
|
|
4- |
Utilize RNA-Seq and microarray technologies for comprehensive gene expression studies.
|
|
5- |
Analyze and interpret gene expression data.
|
|
6- |
Explore the role of gene expression in health and disease.
|
|
7- |
Understand post-transcriptional and epigenetic regulation mechanisms.
|
|
8- |
Stay informed about the latest advancements and techniques in gene expression analysis.
|
|
9- |
|
|
10- |
|
|
*Dersin program yeterliliklerine katkı seviyesi
|
|
1- |
|
|
|
2- |
|
|
|
3- |
|
|
|
4- |
|
|
|
5- |
|
|
|
6- |
|
|
|
7- |
|
|
|
8- |
|
|
|
9- |
|
|
|
10- |
|
|
|
11- |
|
|
|
12- |
|
|
|
13- |
|
|
|
14- |
|
|
|
15- |
|
|
|
16- |
|
|
|
17- |
|
|
|
18- |
|
|
|
19- |
|
|
|
20- |
|
|
|
21- |
|
|
|
22- |
|
|
|
23- |
|
|
|
24- |
|
|
|
25- |
|
|
|
26- |
|
|
|
27- |
|
|
|
28- |
|
|
|
29- |
|
|
|
30- |
|
|
|
31- |
|
|
|
32- |
|
|
|
33- |
|
|
|
34- |
|
|
|
35- |
|
|
|
36- |
|
|
|
37- |
|
|
|
38- |
|
|
|
39- |
|
|
|
40- |
|
|
|
41- |
|
|
|
42- |
|
|
|
43- |
|
|
|
44- |
|
|
|
45- |
|
|
|
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder |
|
Planlanan öğretim faaliyetleri, öğretme metodları ve AKTS iş yükü
|
|
|
Sayısı
|
Süresi (saat)
|
Sayı*Süre (saat)
|
|
Yüz yüze eğitim
|
14
|
2
|
28
|
|
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)
|
14
|
5
|
70
|
|
Ödevler
|
0
|
0
|
0
|
|
Sunum / Seminer hazırlama
|
2
|
2
|
4
|
|
Kısa sınavlar
|
0
|
0
|
0
|
|
Ara sınavlara hazırlık
|
7
|
5
|
35
|
|
Ara sınavlar
|
1
|
2
|
2
|
|
Proje (Yarıyıl ödevi)
|
0
|
0
|
0
|
|
Laboratuvar
|
2
|
2
|
4
|
|
Arazi çalışması
|
0
|
0
|
0
|
|
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık
|
14
|
3
|
42
|
|
Yarıyıl sonu sınavı
|
1
|
2
|
2
|
|
Araştırma
|
0
|
0
|
0
|
|
Toplam iş yükü
|
|
|
187
|
|
AKTS
|
|
|
7.50
|
|
Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
|
|
Yarıyıl içi değerlendirme
|
Sayısı
|
Katkı Yüzdesi
|
|
Ara sınav
|
1
|
40
|
|
Kısa sınav
|
0
|
0
|
|
Ödev
|
0
|
0
|
|
Yarıyıl içi toplam
|
|
40
|
|
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı
|
|
40
|
|
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı
|
|
60
|
|
Genel toplam
|
|
100
|
|
Önerilen veya zorunlu okuma materyalleri
|
|
Ders kitabı
|
1. Molecular Biology of the Gene. Watson, J.D. et al. 6th ed. 2007. Benjamin Cummings. 2. Lewin’s Genes X. Krebs, J.E. et al. 10th ed. 2009. Jones and Bartlett Publishers. 3. Molecular Biology of the Cell. Alberts, B. et al. 5th ed. 2007. Garland Science. 4. Molecular Cell Biology. Lodish, H. et al. 6th ed. 2007. W.H. Freeman and Company.
|
|
Yardımcı Kaynaklar
|
|
|