|
Ön koşul dersleri
|
yok
|
|
Eğitimin dili
|
Türkçe
|
|
Koordinatör
|
DR. ÖĞR. ÜYESİ MERVE ÖZEL YETKİN
|
|
Dersi veren öğretim eleman(lar)ı
|
YRD.DOÇ. DR. RECEP SARAYMEN
|
|
Yardımcı öğretim eleman(lar)ı
|
Anabilim Dalı Araştırma Görevlileri
|
|
Dersin veriliş şekli
|
Teorik-pratik
|
|
Dersin amacı
|
Proteinlerin bulundukları biyosistemlerden izolasyonu, diğer moleküllerden ve birbirlerinden ayrılması ve farklı düzeylerde saflaştırılması için izlenecek deneysel yaklaşımları ve uygulanabilecek yöntemleri öğretmek
|
|
Dersin tanımı
|
Bu ders protein izolasyon metodları, saflaştırılan ve çalışılan protein grupları, saflaştırmada kullanılan kromatografik yöntemler, elektroforetik yöntemler, çöktürme yöntemleri, blotlama işlemlerinin açıklanması ve deneysel olarak uygulanması için düzenlendi.
|
|
1- |
Proteinlerin doğada bulunuşu
|
|
2- |
Biyosistemlerden protein izolasyonu
|
|
3- |
Protein çözeltilerinde derişim
|
|
4- |
Elektroforetik ayırma yöntemleri
|
|
5- |
Poliakrilamid jel elektroforezi
|
|
6- |
İzoelektrik odaklama
|
|
7- |
Membrana aktarım: Blotlama
|
|
8- |
Kromatografik ayırma yöntemleri
|
|
9- |
İyon değişimi kromatografisi
|
|
10- |
Afinite kromatografisi
|
|
11- |
Jel filtrasyonu
|
|
12- |
Protein kristallendirme ve saklama yöntemleri
|
|
13- |
Özel tipte proteinlerin (rekombinant proteinler, membran proteinleri ve antikorlar) saflaştırılması
|
|
14- |
|
|
15- |
|
|
16- |
|
|
17- |
|
|
18- |
|
|
19- |
|
|
20- |
|
|
1- |
Belirlenen hedefe yönelik olarak biyolojik objelerden protein saflaştırma stratejisi geliştirebilme .
|
|
2- |
İzolasyon izolasyonu metodlarını acıklama
|
|
3- |
Proteinlerin nicel ve nitel analizini açıklayabilme
|
|
4- |
Biyolojik materyallerden proteinlerin izolasyonda sıklıkla kullanılan kromatografik yöntemleri bilme
|
|
5- |
Kromatografik ve elektroforetik yöntemlerle protein saflaştırma işlemlerini uygulayabilme
|
|
6- |
Kütle MS yönteminin önemini açıklama
|
|
7- |
|
|
8- |
|
|
9- |
|
|
10- |
|
|
*Dersin program yeterliliklerine katkı seviyesi
|
|
1- |
Histoloji ve Embriyoloji bilim alanında uzmanlık düzeyinde yeterli bilgi birikimine sahip olur,
|
|
|
2- |
Bilimsel bakışa sahip olur,
|
|
|
3- |
insan ve hayvan etiği konusunda bilgi sahibi olur ve buna uygun davranır,
|
|
|
4- |
Bilimsel bir çalışmanın nasıl planlanıp yürütüleceğini öğrenir,
|
|
|
5- |
Araştırma laboratuvarında çalışabilecek bilgi, görgü ve beceri kazanır
|
|
|
6- |
Işık mikroskopi laboratuvarı çalışmalarını yürütme becerisini kazanır,
|
|
|
7- |
Bilimsel yenilikleri takip eder,
|
|
|
8- |
Bağımsız çalışma ve işbirliği yapabilme becerisine sahip olur,
|
|
|
9- |
Sorgulayıcı, araştırıcı ve gözlemci niteliklere sahip olur,
|
|
|
10- |
Karşılaşılan sorunlara çözümsel bakış açısı kazanır,
|
|
|
11- |
Sunum ve aktarma becerisi kazanır,
|
|
|
12- |
|
|
|
13- |
|
|
|
14- |
|
|
|
15- |
|
|
|
16- |
|
|
|
17- |
|
|
|
18- |
|
|
|
19- |
|
|
|
20- |
|
|
|
21- |
|
|
|
22- |
|
|
|
23- |
|
|
|
24- |
|
|
|
25- |
|
|
|
26- |
|
|
|
27- |
|
|
|
28- |
|
|
|
29- |
|
|
|
30- |
|
|
|
31- |
|
|
|
32- |
|
|
|
33- |
|
|
|
34- |
|
|
|
35- |
|
|
|
36- |
|
|
|
37- |
|
|
|
38- |
|
|
|
39- |
|
|
|
40- |
|
|
|
41- |
|
|
|
42- |
|
|
|
43- |
|
|
|
44- |
|
|
|
45- |
|
|
|
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder |
|
Planlanan öğretim faaliyetleri, öğretme metodları ve AKTS iş yükü
|
|
|
Sayısı
|
Süresi (saat)
|
Sayı*Süre (saat)
|
|
Yüz yüze eğitim
|
14
|
3
|
42
|
|
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)
|
14
|
3
|
42
|
|
Ödevler
|
4
|
10
|
40
|
|
Sunum / Seminer hazırlama
|
3
|
5
|
15
|
|
Kısa sınavlar
|
0
|
0
|
0
|
|
Ara sınavlara hazırlık
|
2
|
10
|
20
|
|
Ara sınavlar
|
1
|
5
|
5
|
|
Proje (Yarıyıl ödevi)
|
0
|
0
|
0
|
|
Laboratuvar
|
2
|
3
|
6
|
|
Arazi çalışması
|
0
|
0
|
0
|
|
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık
|
2
|
10
|
20
|
|
Yarıyıl sonu sınavı
|
1
|
5
|
5
|
|
Araştırma
|
0
|
0
|
0
|
|
Toplam iş yükü
|
|
|
195
|
|
AKTS
|
|
|
8.00
|
|
Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
|
|
Yarıyıl içi değerlendirme
|
Sayısı
|
Katkı Yüzdesi
|
|
Ara sınav
|
1
|
40
|
|
Kısa sınav
|
0
|
0
|
|
Ödev
|
0
|
0
|
|
Yarıyıl içi toplam
|
|
40
|
|
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı
|
|
40
|
|
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı
|
|
60
|
|
Genel toplam
|
|
100
|
|
Önerilen veya zorunlu okuma materyalleri
|
|
Ders kitabı
|
Moleküler Biyolojide Kullanılan Yöntemler, 3. Baskı (DVD ile birlikte), Editörler: G. Temizkan ve N. Arda, İ.Ü. Biyoteknoloji ve Genetik Mühendisliği Araştırma ve Uygulama Merkezi (BİYOGEM) Yayın No:3, ISBN: 978-975-420-583-1, Nobel Tıp Kitabevleri, İstanbul, 2008.
|
|
Yardımcı Kaynaklar
|
The Protein Protocols Handbook, J. M. Walker Ed, Humana Press, 2002
Protein Purification: Principles and Practice, R. K. Scopes, Springer, 1994
|
|