|
Ön koşul dersleri
|
|
|
Eğitimin dili
|
|
|
Koordinatör
|
DR. ÖĞR. ÜYESİ ESMA GAMZE AKSEL
|
|
Dersi veren öğretim eleman(lar)ı
|
|
|
Yardımcı öğretim eleman(lar)ı
|
|
|
Dersin veriliş şekli
|
Teorik açıklama uygulama, soru-cevap, danışma, sunum, laboratuvar uygulamaları
|
|
Dersin amacı
|
Biyoinformatik biliminin içerisinde yer alan istatistik yöntemleri ele alınarak uygulama sürecine ilişkin temel bilgilerin verilmesi
|
|
Dersin tanımı
|
|
|
1- |
Allel sayısı, gen çeşitliliği, soydaşım katsayısı gibi toplam istatistikler
|
|
2- |
Allelik, genotipik ve haplotipik frekansının tahmini
|
|
3- |
Hardy-Weinberg eşitliği ve Bağlantı dengesizliği
|
|
4- |
Tasarım Çekirdek kümesi veya haplotip etiketleme işaretçilerinin seçimi
|
|
5- |
Popülasyon farklılaştırma testi; Klasik F İstatistikleri
|
|
6- |
Popülasyon farklılaştırma testi; Klasik F İstatistikleri
|
|
7- |
Vize Sınavı
|
|
8- |
Popülasyona özgü F-İstatistiği
|
|
9- |
Popülasyona özgü F-İstatistiği
|
|
10- |
Filogenetik analizler, Frekans, uzaklık ve ağaç analizi
|
|
11- |
Birliktelik analizi
|
|
12- |
Farklı tasarımlar için ortaklık testi
|
|
13- |
SNP simülasyon ve tanımlama gibi yardımcı program araçları
|
|
14- |
Mantel Olasılık tabloları için test ve tam p değerleri
|
|
15- |
Final Sınavı
|
|
16- |
|
|
17- |
|
|
18- |
|
|
19- |
|
|
20- |
|
|
1- |
|
|
2- |
|
|
3- |
|
|
4- |
|
|
5- |
|
|
6- |
|
|
7- |
|
|
8- |
|
|
9- |
|
|
10- |
|
|
*Dersin program yeterliliklerine katkı seviyesi
|
|
1- |
|
|
|
2- |
|
|
|
3- |
|
|
|
4- |
|
|
|
5- |
|
|
|
6- |
|
|
|
7- |
|
|
|
8- |
|
|
|
9- |
|
|
|
10- |
|
|
|
11- |
|
|
|
12- |
|
|
|
13- |
|
|
|
14- |
|
|
|
15- |
|
|
|
16- |
|
|
|
17- |
|
|
|
18- |
|
|
|
19- |
|
|
|
20- |
|
|
|
21- |
|
|
|
22- |
|
|
|
23- |
|
|
|
24- |
|
|
|
25- |
|
|
|
26- |
|
|
|
27- |
|
|
|
28- |
|
|
|
29- |
|
|
|
30- |
|
|
|
31- |
|
|
|
32- |
|
|
|
33- |
|
|
|
34- |
|
|
|
35- |
|
|
|
36- |
|
|
|
37- |
|
|
|
38- |
|
|
|
39- |
|
|
|
40- |
|
|
|
41- |
|
|
|
42- |
|
|
|
43- |
|
|
|
44- |
|
|
|
45- |
|
|
|
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder |
|
Planlanan öğretim faaliyetleri, öğretme metodları ve AKTS iş yükü
|
|
|
Sayısı
|
Süresi (saat)
|
Sayı*Süre (saat)
|
|
Yüz yüze eğitim
|
14
|
3
|
42
|
|
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)
|
14
|
10
|
140
|
|
Ödevler
|
0
|
0
|
0
|
|
Sunum / Seminer hazırlama
|
0
|
0
|
0
|
|
Kısa sınavlar
|
0
|
0
|
0
|
|
Ara sınavlara hazırlık
|
1
|
8
|
8
|
|
Ara sınavlar
|
1
|
1
|
1
|
|
Proje (Yarıyıl ödevi)
|
0
|
0
|
0
|
|
Laboratuvar
|
0
|
0
|
0
|
|
Arazi çalışması
|
0
|
0
|
0
|
|
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık
|
1
|
8
|
8
|
|
Yarıyıl sonu sınavı
|
1
|
1
|
1
|
|
Araştırma
|
0
|
0
|
0
|
|
Toplam iş yükü
|
|
|
200
|
|
AKTS
|
|
|
8.00
|
|
Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
|
|
Yarıyıl içi değerlendirme
|
Sayısı
|
Katkı Yüzdesi
|
|
Ara sınav
|
1
|
20
|
|
Kısa sınav
|
0
|
0
|
|
Ödev
|
1
|
20
|
|
Yarıyıl içi toplam
|
|
40
|
|
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı
|
|
40
|
|
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı
|
|
60
|
|
Genel toplam
|
|
100
|
|
Önerilen veya zorunlu okuma materyalleri
|
|
Ders kitabı
|
Biyoinformatik Alanında İstatistik, Ezgi Ayyıldız, Vilda Purutçuoğlu , Nobel Yayın Dağıtım, 2014
Introduction to Bioinformatics A Theoretical And Practical Approach, Krawetz, Stephen A., Womble, David D, 2003
|
|
Yardımcı Kaynaklar
|
|
|