| Dersin adı |
Dersin seviyesi |
Dersin kodu |
Dersin tipi |
Dersin dönemi |
Yerel kredi |
AKTS kredisi |
Ders bilgileri |
| PROTEIN RESEARCH METHODS |
İkinci düzey |
BIOL 576 |
Seçmeli |
1 |
7.50 |
7.50 |
Yazdır |
|
Ön koşul dersleri
|
YOK
|
|
Eğitimin dili
|
TÜRKÇE
|
|
Koordinatör
|
PROF. DR. SERVET ÖZCAN
|
|
Dersi veren öğretim eleman(lar)ı
|
PROF. DR. ABDURRAHMAN AYVAZ
|
|
Yardımcı öğretim eleman(lar)ı
|
YOK
|
|
Dersin veriliş şekli
|
Yüz yüze, projeksiyon slaytları ile metin, animasyon ve video sunumu verilir. Ayrıca mekanizmaları açıklamak için bilgisayrdaki çizim programlarından ve online kaynaklardan da yararlanılır.
|
|
Dersin amacı
|
Bu dersin amacı, günümüz protein bilimini iyi bir şekilde anlamak ve öğrencilerin bu alandaki güncel araştırma literatürü hakkında eleştirel düşünebilmelerini sağlamaktır. ALso, protein gradyanında yoğunluk gradyanlı ultrasantrifüj ve diğer ileri laboratuvar teknikleri kullanarak, protein izolasyonu ve saflaştırılması, protein kullanımı ve ölçümü, jel elektroforezi, western immunoblot, ELISA, kolon kromatografisi, HPLC, GCMS, NMR ve lipoprotein ayrımı gibi bir dizi konuyu ele alacağız.
|
|
Dersin tanımı
|
Kimyasal reaksiyonları hızlandıran, hücre şeklini belirleyen, gelişme ve hücre cevaplarını düzenleyen ve çeşitli maddelerin taşınmasını sağlayan proteinler yaşam için son derece önemli olan makromoleküllerdir. Bu ders kapsamında, proteinlerin yapısı, sınıflandırılması, belirlenmesi ve karakterizasyonu belirlemek için yaygın olarak kullanılan metotlar ele alınıp incelenecektir.
|
|
1- |
Biyolojik moleküllerin anlaşılması için önemli olan temel kavramlara giriş,
|
|
2- |
Amino Asitler, Peptidler ve Proteinler
|
|
3- |
Proteinlerin bileşenleri ve bu bileşenlerin bir proteinin aktif ve dinamik şeklinin oluşumuna etkisi
|
|
4- |
Çeşitli protein sınıflarının yapı ve fonksiyonlarının incelenmesi
|
|
5- |
Protein şekli ve bağlanması işlevini nasıl belirler,
|
|
6- |
Neden küçük moleküller fonksiyon ve transport proteinlerinin doğası için önemlidir?
|
|
7- |
Belirli bir proteini saflaştırmak için kullanılabilecek yöntemler.
|
|
8- |
Proteinlerin konsantrasyonunu, moleküler ağırlığını, yapısını ve hücre fonksiyonuna katkılarını belirleyen yöntemler.
|
|
9- |
SDS-PAGE
|
|
10- |
İzoelektrik Odaklama
|
|
11- |
Kromotografik Yöntemler
|
|
12- |
İki boyutlu Jel Elektroforezi
|
|
13- |
WESTERN BLOTT
|
|
14- |
Proteinlerin tanımlanması ve karakterizasyonu
|
|
15- |
Edman degradasyonu ve mass spektrometri
|
|
16- |
|
|
17- |
|
|
18- |
|
|
19- |
|
|
20- |
|
|
1- |
• Bilişsel beceriler - Protein yapı-fonksiyon ilişkileri ile ilgili olarak moleküler düzeyde temel unsurların öğrenilmesi, protein yapı ve fonksqiyonu hakkında teorik ve deneysel bilgiler edinir.
|
|
2- |
• Öğrenme becerileri - yapısal biyokimya hakkında bilimsel bir metnini okuma, anlama ve eleştirme becerisi. - Bu bilgileri, hem nitel hem de nicel açıdan bir araştırma projesinin amaçlarını ve / veya sonuçlarını değerlendirmek için kullanma becerisi edinir.
|
|
3- |
Pratik ve konuya özgü beceriler - Biyokimya ve moleküler biyoloji alanındaki bilgileri bir protein mühendisliği projesine uygulayabilme ve Analitik problem çözme yaklaşımı önerebilme becerisi edinir.
|
|
4- |
İletişim becerileri - ilgili bilgileri tanımlama ve ifade etme yeteneği kazanır ve pratik yaparak, okuyarak, yazarak ve konuşarak etkili iletişim becerileri edinir ve ayrıca bilimsel bilgiyi sürdürme ve sunma becerisi kazanır.
|
|
5- |
|
|
6- |
|
|
7- |
|
|
8- |
|
|
9- |
|
|
10- |
|
|
*Dersin program yeterliliklerine katkı seviyesi
|
|
1- |
Lisans derecesi yeterlilikleri üzerine kurulan, aynı ya da farklı bir alandaki bilgilerin genişletilmesi ve derinleştirilmesi ile birlikte bilgiyi değerlendirme,yorumlama ve uygulama yapma gibi bilimsel araştırma yöntemlerini kullanarak bilgiye ulaşır
|
|
|
2- |
Biyoloji alanındaki sınırlı ya da eksik verileri kullanarak bilimsel yöntemlerle bilgiyi geliştirir, bilimsel, toplumsal ve etik sorumluluk ile kullanır
|
|
|
3- |
Biyoloji alanındaki bir problemi, bağımsız olarak kurgulayarak, çözüm yöntemi geliştirir, çözer, sonuçları değerlendirerek, gerektiğinde uygular
|
|
|
4- |
Biyoloji alanındaki güncel gelişmeleri ve kendi çalışmalarını, alanındaki ve dışındaki gruplara, yazılı, sözlü ve görsel olarak sistemli bir şekilde aktarır
|
|
|
5- |
Biyoloji alanındaki uygulamalarda karşılaşacağı öngörülmeyen karmaşık durumlarda, yeni stratejik yaklaşımlar geliştirir ve sorumluluk alarak çözüm üretir
|
|
|
6- |
Biyoloji alanı ile ilgili konularda strateji, politika ve uygulama planları geliştirir ve elde edilen sonuçları, kalite süreçleri çerçevesinde değerlendirir
|
|
|
7- |
En az bir yabancı dilde sözlü ve yazılı iletişim yeteneğine sahip olur (Avrupa Dil Portföyü B2 Genel Düzeyi)
|
|
|
8- |
Biyoloji alanının gerektirdiği bilgisayar yazılımı ve donanımı bilgisi ile birlikte bilişim ve iletişim teknolojilerini kullanır ve geliştirir
|
|
|
9- |
Biyoloji alanı ile ilgili verilerin toplanması, yorumlanması, duyurulması aşamalarında bilimsel, sosyal ve etik değerleri gözeterek bu değerleri öğretir ve denetler
|
|
|
10- |
|
|
|
11- |
|
|
|
12- |
|
|
|
13- |
|
|
|
14- |
|
|
|
15- |
|
|
|
16- |
|
|
|
17- |
|
|
|
18- |
|
|
|
19- |
|
|
|
20- |
|
|
|
21- |
|
|
|
22- |
|
|
|
23- |
|
|
|
24- |
|
|
|
25- |
|
|
|
26- |
|
|
|
27- |
|
|
|
28- |
|
|
|
29- |
|
|
|
30- |
|
|
|
31- |
|
|
|
32- |
|
|
|
33- |
|
|
|
34- |
|
|
|
35- |
|
|
|
36- |
|
|
|
37- |
|
|
|
38- |
|
|
|
39- |
|
|
|
40- |
|
|
|
41- |
|
|
|
42- |
|
|
|
43- |
|
|
|
44- |
|
|
|
45- |
|
|
|
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder |
|
Planlanan öğretim faaliyetleri, öğretme metodları ve AKTS iş yükü
|
|
|
Sayısı
|
Süresi (saat)
|
Sayı*Süre (saat)
|
|
Yüz yüze eğitim
|
14
|
3
|
42
|
|
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)
|
14
|
2
|
28
|
|
Ödevler
|
2
|
6
|
12
|
|
Sunum / Seminer hazırlama
|
1
|
2
|
2
|
|
Kısa sınavlar
|
1
|
2
|
2
|
|
Ara sınavlara hazırlık
|
1
|
10
|
10
|
|
Ara sınavlar
|
1
|
2
|
2
|
|
Proje (Yarıyıl ödevi)
|
1
|
5
|
5
|
|
Laboratuvar
|
2
|
10
|
20
|
|
Arazi çalışması
|
1
|
2
|
2
|
|
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık
|
1
|
20
|
20
|
|
Yarıyıl sonu sınavı
|
1
|
2
|
2
|
|
Araştırma
|
4
|
10
|
40
|
|
Toplam iş yükü
|
|
|
187
|
|
AKTS
|
|
|
7.50
|
|
Değerlendirme yöntemleri ve kriterler
|
|
Yarıyıl içi değerlendirme
|
Sayısı
|
Katkı Yüzdesi
|
|
Ara sınav
|
1
|
60
|
|
Kısa sınav
|
2
|
20
|
|
Ödev
|
2
|
20
|
|
Yarıyıl içi toplam
|
|
100
|
|
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı
|
|
40
|
|
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı
|
|
60
|
|
Genel toplam
|
|
100
|
|
Önerilen veya zorunlu okuma materyalleri
|
|
Ders kitabı
|
Principles and Techniques of
Biochemistry and Molecular Biology
Seventh edition
Edited by Keith WILSON AND John WALKER
|
|
Yardımcı Kaynaklar
|
INTRODUCTION TO PROTEOMICS, By DANIEL C. LIEBLER, PhD, Humana Press Totowa, NJ
|
|