Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
GENOME BIOINFORMATICS	Üçüncü Düzey	AGS 693	Seçmeli	1	7.50	7.50	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	-
Eğitimin Dili	İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	YRD.DOÇ. DR. OSMAN İBİŞ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	-
Dersin Veriliş Şekli	Yüz yüze
Dersin Amacı	Bu dersin amacı, öğrencilerin biyoenformatik alanına hızla ulaşmalarına yardımcı olmak ve kendi araştırma alanlarındaki problemleri çözmek için biyoenformatik araçları kullanabilmelerini sağlamaktır.
Dersin Tanımı	Genom Biyoinformatik dersi Genom biyoinformatiğinde kullanılan en önemli ve temel kavramları, yöntemleri ve araçları tanıtmak üzere tasarlanmıştır. Bu ders biyolojik bilimlerde yeni ve hızla gelişen biyoinformatik alanına titiz, disiplinler arası bir yaklaşım sağlamaktadır. Ayrıca biyolojik veriler, genom evrimi ve varyasyonları ve biyolojik veri tabanlarının düzenlenmesi, analizi, karşılaştırılması ve anatasyonunda faydalı bilgiler sunacaktır.

Dersin İçeriği

1	Biyoinformatikte kullanılan en önemli ve temel kavramlar, yöntemler ve araçlara giiriş
2	Nükleotid dizi veritabanlarına giriş
3	Protein dizi veritabanları
4	Sanger ve yeni nesil sekanslama teknolojileri
5	Pairwise sekans alignment ve veritabanı araması
6	Patern, Profil ve Multiple sekans alignment ve algoritmalar
7	örnek çalışma
8	Ara sınav
9	Veri tabanına sekans veri girişi
10	Genom varyasyon ve evrim araştırmaları
11	biyolojik dizilerin anatasyonu
12	Filogenetik ve filogenomik analizler
13	Gen ifadesi ve DNA mikroarrayler
14	örnek çalışma
15	Final sınavı
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Öğrenciler genom biyoinformatik araçlarını kullanabilecektir.
2	Öğrenciler genom biyoinformatikde kullanılan en önemli ve temel kavram, yöntem ve araçları anlayacaklardır.
3	Bu ders biyolojik bilimlerde yeni ve hızla gelişen genom biyoinformatik alanında titiz, disiplinler arası bir bilgi sunmaktadır.
4
5
6
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	3	14	42
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	3	14	42
Ödevler	2	14	28
Sunum / Seminer hazırlama	2	14	28
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	14	14
Ara sınavlar	1	1	1
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	2	14	28
Yarıyıl sonu sınavı	1	1	1
Araştırma	0	0	0
Toplam iş yükü			184
AKTS			7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	40
Kısa sınav	0	0
Ödev	0	0
Yarıyıl içi toplam		40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	Lesk, Arthur. Introduction to bioinformatics. Oxford University Press, 2013.
Yardımcı Kaynaklar

Ders İle İlgili Dosyalar