Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
MICROBIAL GENOMICS AND PROTEOMICS	Üçüncü Düzey	AGS 648	Seçmeli	2	7.50	7.50	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Temel moleküler biyoloji ve biyokimya bilgisi
Eğitimin Dili	İngilizce
Koordinatör
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	Prof. Dr. Semih YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Research assistant Ahmet Enes URAY
Dersin Veriliş Şekli	Yüz yüze, interaktif eğitim
Dersin Amacı	Kursun genel amacı genomics ve protemics alanlarındaki temel uygulama alanları ve metotların açıklanmasıdır. Özelde ise genomiğin tarihsel ve gelişimsel perspektifini, proteomik ve proteogenomik yöntemleri, prokaryot genomların yapısal organizasyonunu içerir.
Dersin Tanımı	Bu ders fonksiyonel genomik ve proteomik ile ilgili bilgi ve becerileri kazandırmayı amaçlar. Özellikle prokaryotlarda (bakteri) kullanılan teknikler üzerinde durulmuştur. Organizmaların tüm genom düzeyinde değişen çevre koşullarına verdiği tepki açıklanacaktır.

Dersin İçeriği

1	Genom boyutu
2	Nükleotit ve yapısal değişkenlik
3	Genomik ve çeşitlilik
4	Prokaryotik genomların yapısı, organizasyonu ve içeriği
5	Mikrobiyal genomik ve genom epidemiyolojisi
6	Proteomiğin Biyoteknolojik Uygulamaları
7	Proteomiğin Biyoteknolojik Uygulamaları
8	Ara sınav
9	Fonksiyonel genomiğin temel yaklaşımları, reverse ve forward genetik
10	Çeşitli örnek türlerinden temel protein izolasyon yöntemleri; elektroforetik ayırma teknikleri
11	Protein biyolojik fonksiyonunu anlama
12	Protein biyolojik fonksiyonunu anlama
13	Post translasyonel modifikasyonlar
14	Patojen tanımlama (“BioTyper”)
15	Protein miktar tayini
16	Protein izolatlarının hazırlanması ve proteinlerin ve peptidlerin fraksiyonlanması/ayrılması
17	Final sınavı
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Fonksiyonel genomik ve proteomiğin tarım, ekotoksikoloji ve insan sağlığı alanındaki kullanımlarını tartışmak
2	Genom ve proteomik alanında kullanılan teknolojilerin seçiminde kullanılan yöntem ve uygulamaları anlamak
3	Çeşitli kaynaklardan gelen bilgileri değerlendirerek biyoteknolojideki problemleri kritik analiz edebilme ve çözebilme
4	İfade çalışmaları ile elde edilen verileri yorumlayabilme
5	Kendi kendine öğrenme sürecini gerçekleştirebilme
6	Prokaryotik genom ve proteomlardaki farklı bileşenleri tanımlamak ve açıklayabilme
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	13	3	39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	13	5	65
Ödevler	3	15	45
Sunum / Seminer hazırlama	4	4	16
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	10	10
Ara sınavlar	1	2	2
Proje (Yarıyıl ödevi)	0	0	0
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	1	10	10
Yarıyıl sonu sınavı	1	5	5
Araştırma	0	0	0
Toplam iş yükü			192
AKTS			7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	40
Kısa sınav	0	0
Ödev	0	0
Yarıyıl içi toplam		40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	ProteomicsDB: : http://www.proteomicsdb.org/ Kraj, A. & Silberring J. Introduction to Proteomics. Ed. Wiley, UK 2008.
Yardımcı Kaynaklar	Brown, T. A. Genomes. Garland Science, UK. 2009, 3rd edition. Lovrik, J. Introducting Proteomics: From concepts to sample separation, mass spectroetry and data analysis. Ed. Wiley-Blackwell, UK, 2011.

Ders İle İlgili Dosyalar