Erciyes University - Info Package

Dersin Adı	Dersin Seviyesi	Dersin Kodu	Dersin Tipi	Dersin Dönemi	Yerel Kredi	AKTS Kredisi	Ders Bilgileri
PROTEIN METABOLISM	Üçüncü Düzey	AGS 683	Seçmeli	1	7.50	7.50	Yazdır

Dersin Tanımı

Ön Koşul Dersleri	Yok
Eğitimin Dili	İngilizce
Koordinatör	PROF. DR. SEMİH YILMAZ
Dersi Veren Öğretim Eleman(lar)ı	Prof. Dr. Semih YILMAZ
Yardımcı Öğretim Eleman(lar)ı	Arş. Gör. Ahmet Enes URAY
Dersin Veriliş Şekli	Yüz yüze, interaktif eğitim
Dersin Amacı	Bu ders hücrelerin metabolik işleyişi ile proteinlerin bağlantısını, protein domainlerinin görevini, mutasyonların etkisini ve termodinamik stabilitesini kavratmak amacıyla hazırlanmıştır.
Dersin Tanımı	Ders temel olarak fonksiyonel protein gruplarının metabolik etkileri, protein katlanması, proteinlerin termodinamik stabilitesi, solvent ve termal denatürasyon konularına odaklanacaktır. Bu ders dinamik ve işlevsellik konusunda kavramsal ve pratik bir arka plan sağlayacaktır. Proteomik dünyasına daha kapsamlı bir giriş yapılmasına ve ayrıca proteomik çalışmaları yoluyla organizmaların biyolojik özelliklerine ilişkin önemli bilgiler sunacaktır.

Dersin İçeriği

1	Protein yapı stabilizasyonu
2	Protein yapısı, stabilitesi ve fonksiyonu arasındaki termodinamik ilişkiler
3	Protein katlanması-termodinamik ilişki
4	Protein katlanmasında hidrofobik-hidrofilik ilişkiler
5	Hidrojen değişimi-protein konformasyonel stabilitesi
6	Protein katlanması-konformasyonel entropi
7	Protein katlanması/denatürasyonu moleküler dinamikleri
8	ARA SINAV
9	Solvent, termal denatürasyon etkisi
10	Isı değişimi-stabilite kapasitesi
11	Yüzey mutasyonları
12	Bağlama bölgeleri termodinamik özellikleri
13	Prolin izomerizasyon etkisi
14	Fonksiyonel protein grupları
15	FİNAL SINAVI
16
17
18
19
20

Dersin Öğrenme Çıktıları

1	Protein stabilitesi ve termodinamik ilişkiyi anlamak
2	Katlanmada termodinamik bağlantıları açıklamak
3	Hidrojen ekleme çıkarma ile konformasyonel stabilite bağlantısını açıklamak
4	Stabilitede hücre içi ve dışı solvent kondantrasyonu ve termal etkiyi açıklamak
5	Protein bağlanma bölgelerinde termodinamik etkiyi açıklamak
6	Metabolizmada fonksiyonel protein gruplarını açıklamak
7
8
9
10

*Dersin Program Yeterliliklerine Katkı Seviyesi

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
Yıldızların sayısı 1’den (en az) 5’e (en fazla) kadar katkı seviyesini ifade eder

Planlanan Öğretim Faaliyetleri, Öğretme Metodları ve AKTS İş Yükü

	Sayısı	Süresi (saat)	Sayı*Süre (saat)
Yüz yüze eğitim	13	3	39
Sınıf dışı ders çalışma süresi (ön çalışma, pekiştirme)	5	7	35
Ödevler	3	20	60
Sunum / Seminer hazırlama	2	5	10
Kısa sınavlar	0	0	0
Ara sınavlara hazırlık	1	10	10
Ara sınavlar	1	3	3
Proje (Yarıyıl ödevi)	1	5	5
Laboratuvar	0	0	0
Arazi çalışması	0	0	0
Yarıyıl sonu sınavına hazırlık	1	10	10
Yarıyıl sonu sınavı	1	3	3
Araştırma	1	10	10
Toplam iş yükü			185
AKTS			7.50

Değerlendirme yöntemleri ve kriterler

Yarıyıl içi değerlendirme	Sayısı	Katkı Yüzdesi
Ara sınav	1	30
Kısa sınav	0	0
Ödev	1	10
Yarıyıl içi toplam		40
Yarıyıl içi değerlendirmelerin başarıya katkı oranı		40
Yarıyıl sonu sınavının başarıya katkı oranı		60
Genel toplam		100

Önerilen Veya Zorunlu Okuma Materyalleri

Ders kitabı	Kenneth P. Murphy (auth.), Kenneth P. Murphy (eds.) - Protein Structure, Stability, and Folding-Humana Press (2001)
Yardımcı Kaynaklar	Johannes Buchner, Thomas Kiefhaber - Protein Folding Handbook. 5-volume set-Wiley-VCH (2005)

Ders İle İlgili Dosyalar